將 Rcpp 文件添加到現有的 r 包中？

Question

我已經制作了一個簡單的 R 包（純 R）來解決蠻力問題，然后我嘗試通過編寫 Rcpp 腳本來加快代碼速度。 我編寫了一個腳本來將運行時間與“bench”庫進行比較。 現在，我如何將此腳本添加到我的包中？ 我試着添加

#'@importFrom Rcpp cppFunction 

在我的 R 腳本之上並在 scr 文件夾中插入 Rcpp 文件但沒有用。 有沒有辦法將它添加到我的 r 包中而無需從頭開始創建包？ 對不起，如果已經有人問過了，但我對這一切都很陌生，完全迷失了。

Answer 1

這種轉換實際上（仍然）非常困難（從需要多個文件的意義上說）。 很容易忽略細節。 讓我帶你了解原因。

讓我們假設您使用 R 包package.skeleton()啟動了一個工作包。 這是最簡單和最普遍的情況。 該包將工作（但有警告，請參閱我的pkgKitten包中的包裝而不是清理，以及 CRAN 上的十幾個其他包幫助功能和包）。 特別要注意的是，我沒有提到roxygen2 ，這在這一點上只是一個額外的復雜問題，所以讓我們只關注.Rd文件。

您現在可以將最簡單的包與由Rcpp構建並為Rcpp構建的包進行Rcpp ，即使用Rcpp.package.skeleton() 。 你至少會看到這些差異

• DESCRIPTION為LinkingTo:和Imports
• NAMESPACE用於importFrom以及useDynLib行
• 一個新的src目錄和對src/Makevars的可能需要

所有這些都使（基本上）通過Rcpp.package.skeleton()啟動一個新包變得更容易，並將您現有的包代碼復制到該包中。 我們根本沒有轉換助手。 我仍然會時不時地進行您嘗試的“手動轉換”，即使我需要嘗試一兩次，而且我已經多次看到所有錯誤消息......

因此，即使您不想“復制所有內容”，我認為最簡單的方法是

• 使用和不使用Rcpp創建兩個包
• 做一個遞歸diff
• 確保差異適用於您的原始包裝。

PS 並且請記住，當您使用roxygen2並在src/目錄中有文檔時，請始終先運行Rcpp::compileAttributes()然后再運行roxygen2::roxygenize() 。 RStudio 和其他助手會為您完成此操作，但仍然很容易忘記...