繪制 R 中的行與列

Question

假設我有一個 dataframe，其中行對應於樣本，每列對應於樣本中某些分子出現的頻率。 我如何創建一個 plot，以便每個分子名稱位於 x 軸上，並且它在每個樣本中出現的頻率位於 y 軸上。

例如：

temp <- data.frame(mol1 = c(0.2,0.3,0.5), 
                   mol2 = c(0.4,0.7,0.3), 
                   mol3 = c(0.1, 0, 0.8))
rownames(temp) <- c("S1", "S2", "S3")

在 x 軸上會有一個“mol1”的勾號，上面標有 0.2、0.3 和 0.5 的值或帶有圖例。 其他分子也一樣。

Answer 1

也許你可以嘗試 plot 與ggplot ：

library(tidyverse)

temp %>%
  rownames_to_column('sample') %>%
  pivot_longer(cols = -sample, names_to = 'molecule') %>%
  ggplot() + aes(sample, value, color = molecule) + 
 geom_point(size = 3) + theme_bw()