檢查列表中的元素是否存在於 txt 文件的字符串中（不工作） Python

Question

我嘗試了很多方法，但我根本沒有得到任何 output。 我有一個包含不同類型字符串的列表：

lst=['ATCGG','GTAACGCT','AATCGAT',...]

我有一個如下的文本文件：

>seq1
NNNGTAACGCTNNN
>seq2
NNNNNAATCGATNNNN
>seq3
NNNNNNNN
.
.
.

如果行中存在列表中的任何項目，我想打印文本文件的行。 根據以上示例，所需的 output 應為：

NNNGTAACGCTNNN
NNNNNAATCGATNNNN

我使用了下面的命令，但沒有打印出來：

main_file =  open('test_file.txt', 'r')
contn = main_file.read()
#print(contn)


for dna in contn:
    if any(i in dna for i in lst):
        print(dna)

Answer 1

您需要readlines而不是read ， read 將創建一個字符串，因此當您迭代時， dna實際上只是單個字符

contn = main_file.read()

應該

contn = main_file.readlines()

Answer 2

直觀的顯式循環版本：

def find_lines_containing_any(filename, wanted_list):
    with open(filename, 'r') as dna_file:
       for dna_line in dna_file:
            for wanted in wanted_list:
                if wanted in dna:
                    yield dna

for dna in find_lines('test_file.txt', lst):
    print(dna)

Answer 3

使用for dna in contn ，您正在遍歷字符，因為read()返回str object，您可以簡單地執行以下操作：

main_file =  open('test_file.txt', 'r')
for line in main_file:
    if any(i in line for i in lst):
        print(line)