RScript - ggplot() 和 ggsave() 循環不遍歷列表

Question

我正在嘗試使用帶有 ggplot() 和 ggsave() 的循環來使用以下代碼從單獨的數據框列表中創建一組圖：

temp2 = list(gsub("*.txt.out$", "", list.files(pattern="*.out")))
for (i in 1:length(temp2)) {
    Eg_cluster = temp2[[i]]
    df = data.frame(eval(parse(text = Eg_cluster)))
    myplot = ggplot(df, aes(xmin = start, xmax = end, y = molecule, fill = gene)) +
        geom_gene_arrow() +
        facet_wrap(~ molecule, scales = "free", ncol = 3) +
        scale_fill_brewer(palette = "Set3") +
        theme_genes() + ggtitle("snoRNA Cluster ", Eg_cluster)
    ggsave(file = print(paste0(Eg_cluster, ".pdf")), plot = myplot, device = "pdf")
}

該代碼成功地從列表中的第一個數據幀輸出了第一個 plot，但循環似乎沒有遍歷列表並在 ggsave 中生成圖的 rest。 有沒有人對為什么不輸出繪圖的 rest 有任何見解？

提前謝謝了！

Answer 1

您正在將 temp 2 設為長度為 1 的列表。

temp2 = gsub("*.txt.out$", "", list.files(pattern="*.out"))