[英]OpenMP parallel instantiation and modification of vector of vectors
我正在使用 OpenMP 來並行化 Boost::geometry 多邊形( BPolygon
)上的一些聯合操作。 但是,我偶然發現了僅不時發生的非常奇怪的異常(盡管我的 RNG 被播種了相同的種子)所以我想知道我是否忽略了 OpenMP 並行化和容器的一些未定義行為......
該代碼是一個大型且相當復雜的集合的一部分,因此我無法真正提供 MWE,但相關部分如下:
std::unordered_map<size_t, std::vector<std::vector<BPolygon>>> container;
#pragma omp parallel
{
std::vector<BPolygon> vec_geom;
#pragma omp for
for (size_t gid : gids)
{
[...]
auto iter_block, iter_block_end;
container[gid] = std::vector<std::vector<BPolygon>>();
while (iter_block != iter_block_end)
{
auto iter_node = neurite_it->second->nodes_cbegin();
auto iter_node_end = neurite_it->second->nodes_cend();
// store the union in vec_geom
vec_geom.clear();
while (iter_node != iter_node_end)
{
cascading_union(node_it->second, vec_geom);
iter_node++;
}
// add the union to the container
container[gid].push_back(vec_geom);
iter_block++;
}
}
}
級聯聯合 function 是
void cascading_union(TNodePtr n, std::vector<BPolygon> &vec_geom)
{
auto range = n->segment_range();
auto seg_it = range.begin();
auto seg_end = range.end();
std::vector<BPolygon> vec, vec_tmp;
BPolygon poly1, poly2;
// container associated to `range` cannot be modified so
// we store the first unions in a new vector
while (seg_it != seg_end)
{
poly1 = *((*seg_it).get());
seg_it++;
if (seg_it != seg_end)
{
poly2 = *((*seg_it).get());
bg::union_(poly1, poly2, vec_tmp);
vec.push_back(vec_tmp[0]);
vec_tmp.clear();
}
else
{
vec.push_back(poly1);
}
}
stype imax(vec.size()), imax2;
// cascading union on final vector
while (imax > 1)
{
imax2 = 0;
for (stype i=0; i < imax; i += 2)
{
poly1 = vec[i];
if (i + 1 < imax)
{
poly2 = vec[i + 1];
bg::union_(poly1, poly2, vec_tmp);
vec[imax2] = vec_tmp[0];
vec_tmp.clear();
}
else
{
vec[imax2] = poly1;
}
imax2++;
}
vec.resize(imax2);
imax = imax2;
}
if (imax > 0)
{
vec_geom.push_back(vec.back());
}
}
遇到的錯誤類型有:
container[gid] = std::vector<std::vector<BPolygon>>();
munmap_chunk(): invalid pointer
(精確位置未知)cascading_union
:bg::union_
中的段錯誤free(): invalid next size (fast)
(精確位置未知)malloc(): unaligned tcache chunk detected
(精確位置未知)請讓我知道完整的回溯是否有用。
我想知道,盡管容器應該是線程安全的,但這可能是一個問題,因為我在這里處理的是容器內的可變大小對象。
注意:這些錯誤源於最近的重組,所以我認為多邊形或底層結構沒有問題,因為以前的實現中沒有這些錯誤。
感謝評論,我意識到我關於容器是線程安全的想法是錯誤的(它們可以安全閱讀但不能修改)。
分配和對push_back
的調用必須包含在
#pragma omp critical
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