[英]How to put a colorbar in seaborn scatterplot legend
我有下一個散點圖
但我想通過連續顏色 map 改變圖例上的點,如下所示:
這是我的代碼:
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
sns.set_style("whitegrid")
gene_list = pd.read_csv('interseccion.csv', header=None)
glist = gene_list.squeeze().str.strip().tolist()
names = gp.get_library_name()
enr = gp.enrichr(gene_list= glist,
gene_sets=['KEGG_2019_Human'],
organism='Human', # don't forget to set organism to the one you desired! e.g. Yeast
description='KEGG',
# no_plot=True,
cutoff=0.5 # test dataset, use lower value from range(0,1)
)
resultados = enr.results.head(15)
resultados['-log10(FDR)'] = -np.log10(resultados['Adjusted P-value'])
resultados['Genes'] = resultados['Genes'].str.split(';')
resultados['Genes'] = resultados['Genes'].apply(lambda x: len(x))
g = sns.scatterplot(data=resultados, x="-log10(FDR)", y="Term", hue='-log10(FDR)', palette="seismic"
, size="Genes", sizes=(30, 300), legend=True)
g.legend(loc=6, bbox_to_anchor=(1, 0.5), ncol=1)
g.fig.colorbar()
plt.ylabel('')
plt.xlabel('-log10(FDR)')
當我嘗試使用功能 plt.colorbar() 放置彩條時是不可能的
我自定義了官方示例中的代碼,了解我想在 Seaborn 散點圖中添加圖例和彩條。 已創建顏色圖以匹配示例圖的 colors,但通過指定顏色圖名稱可以毫無問題地繪制它。 彩條是通過獲取其 position 並在圖例中手動調整來定制的。 顏色條的高度減半以匹配圖例。
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
tips = sns.load_dataset("tips")
fig, ax = plt.subplots()
g = sns.scatterplot(
data=tips, x="total_bill", y="tip", hue="size", size="size",
sizes=(20, 200), legend="full", ax=ax)
g.legend(loc='upper right', bbox_to_anchor=(1.2, 1.0), ncol=1)
norm = plt.Normalize(tips['size'].min(), tips['size'].max())
cmap = sns.cubehelix_palette(light=1, as_cmap=True)
sm = plt.cm.ScalarMappable(cmap=cmap, norm=norm)
sm.set_array([])
cax = fig.add_axes([ax.get_position().x1+0.05, ax.get_position().y0, 0.06, ax.get_position().height / 2])
ax.figure.colorbar(sm, cax=cax)
plt.show()
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