Ggplot2 - 簡單的圖例和着色

Question

我了解 ggplot2 使用圖形語法的概念。 在這里，我嘗試使用帶有簡單圖例的分層着色方案，但我並沒有取得太大的成功。 我希望下面的第一個 geom_point() 全部為黑色，第二個全部為藍色（僅用於統計顯着點），第三個為紅色。 對於傳說，我希望黑色是“不重要的”，藍色是“重要的”，紅色是“已發表的基因”。 任何人都可以提供幫助或提供一些建議嗎？

gene_count.poly <-
      ggplot() +
      labs(title="Poly Untreated vs. Treated",
           x ="log2(Poly Untreated)", y = "log2(Poly Treated)") +
      geom_point(data=normalized_all_counts.poly, aes(x=log2(avg_rep1),
                                                      y=log2(avg_rep2)), color="black") +
      geom_point(data=significant_normalized_all_counts.poly, aes(x=log2(avg_rep1),
                                                                  y=log2(avg_rep2)), color="blue") +
      geom_point(data=significant_normalized_all_counts.poly, aes(x=log2(avg_rep1),
                                                                  y=log2(avg_rep2)), color = significant_normalized_all_counts.poly$genecolor)
      
    
    
    print(gene_count.poly)

Answer 1

這是您使用內置mtcars數據集描述的示例。

library(ggplot2); library(dplyr)
ggplot(mtcars, aes(wt, mpg)) +
  geom_point(data = filter(mtcars, mpg > 25),
             aes(color = "high mpg")) +
  geom_point(data = filter(mtcars, wt > 5),
             aes(color = "high weight")) +
  geom_point(data = filter(mtcars, wt == 3.44),
             aes(color = "one particular weight")) +
  scale_color_manual(values = c("high mpg" = "black",
                                "high weight" = "blue",
                                "one particular weight" = "red"))