使用 Databricks 中的 PySpark 獲取 S3 中的文件列表

Question

我正在嘗試生成存儲桶/文件夾中所有 S3 文件的列表。 文件夾中通常有數百萬個文件。 我現在使用 boto，它每分鍾可以檢索大約 33k 個文件，即使是 100 萬個文件，也需要半小時。 我還將這些文件加載​​到數據框中，但生成並使用此列表作為跟蹤正在處理的文件的一種方式。

我注意到的是，當我要求 Spark 讀取文件夾中的所有文件時，它會列出自己的列表，並且能夠比 boto 調用更快地列出它們，然后處理這些文件。 我在 PySpark 中查找了一種方法來執行此操作，但沒有找到好的示例。 我得到的最接近的是一些 Java 和 Scala 代碼，用於列出使用 HDFS 庫的文件。

有沒有辦法在 Python 和 Spark 中做到這一點？ 作為參考，我正在嘗試復制以下代碼片段：

def get_s3_files(source_directory, file_type="json"):
    s3_resource = boto3.resource("s3")

    file_prepend_path = f"/{'/'.join(source_directory.parts[1:4])}"
    bucket_name = str(source_directory.parts[3])
    prefix = "/".join(source_directory.parts[4:])

    bucket = s3_resource.Bucket(bucket_name)

    s3_source_files = []

    for object in bucket.objects.filter(Prefix=prefix):
        if object.key.endswith(f".{file_type}"):
            s3_source_files.append(
                (
                    f"{file_prepend_path}/{object.key}",
                    object.size,
                    str(source_directory),
                    str(datetime.now()),
                )
            )

    return s3_source_files

Answer 1

這可以通過dbutils非常簡單地實現。

def get_dir_content(ls_path):
  dir_paths = dbutils.fs.ls(ls_path)
  subdir_paths = [get_dir_content(p.path) for p in dir_paths if p.isDir() and p.path != ls_path]
  flat_subdir_paths = [p for subdir in subdir_paths for p in subdir]
  return list(map(lambda p: p.path, dir_paths)) + flat_subdir_paths
    

paths = get_dir_content('s3 location')
[print(p) for p in paths]

Answer 2

出於某種原因，使用 AWS CLI 命令大約比使用 boto 快 15 倍（！）。 不確定為什么會這樣，但這是我目前正在使用的代碼，以防有人發現它很方便。 基本上，使用s3api列出對象，然后使用jq操作輸出並將其變成我喜歡的形式。

def get_s3_files(source_directory, schema, file_type="json"):

    file_prepend_path = f"/{'/'.join(source_directory.parts[1:4])}"
    bucket = str(source_directory.parts[3])
    prefix = "/".join(source_directory.parts[4:])

    s3_list_cmd = f"aws s3api list-objects-v2 --bucket {bucket} --prefix {prefix} | jq -r '.Contents[] | select(.Key | endswith(\".{file_type}\")) | [\"{file_prepend_path}/\"+.Key, .Size, \"{source_directory}\", (now | strftime(\"%Y-%m-%d %H:%M:%S.%s\"))] | @csv'"

    s3_list = subprocess.check_output(s3_list_cmd, shell=True, universal_newlines=True)

    with open(f"s3_file_paths.csv", "w") as f:
        f.truncate()
        f.write(s3_list)

    s3_source_files_df = spark.read.option("header", False).schema(schema).csv(f"s3_file_paths.csv")

    return s3_source_files_df