使用奇點 linux 代替 docker-compose

Question

感謝您查看我的問題！

問題：我對 docker 和 linux 還很陌生。 我想在我的 linux dist（CentOS 版本 7）中運行 docker 映像，我無法更改根目錄。 Singularity v.3.6.4 已安裝，我使用以下命令提取 docker 映像：

module load singularity/3.6.4
singularity pull docker://usdaarsnwrc/awsm:0.10

請注意，因為我無法更改根目錄，所以我已將 SINGULARITY_TMPDIR 和 SINGULARITY_CACHEDIR 設置為我的主目錄。

這工作沒有錯誤。

然后我下載一個測試用例：

git clone https://github.com/USDA-ARS-NWRC/awsm_test_cases.git

並嘗試使用他們建議的命令運行它：

python ./awsm_docker --case tuol

我收到以下錯誤：

/bin/sh: docker-compose: command not found
Traceback (most recent call last):
File "./awsm_docker", line 73, in <module>
     run()
File "./awsm_docker", line 55, in run
os.remove('./{}/topo/maxus.nc'.format(fpc))
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: './tuolumne/topo/maxus.nc'

問題
似乎此錯誤是由測試數據文件夾中包含的腳本 awsm_docker 導致的，該腳本在兩個實例中調用 docker-compose。 前任：

    run_call = ('docker-compose'
                ' -f ./{}/docker-compose.yml'
                ' run awsm /data/input/{}').format(fpc, cfg)
    call(run_call, shell=True, universal_newlines=True)

所以看起來我的問題是將 docker-compose 翻譯成與奇異性兼容的語言？ 關於這將如何工作的任何想法？

謝謝您的幫助！

Answer 1

盡管兩者都是容器，但 Singularity 不能總是用作 Docker 的替代品。 當涉及到 docker-compose 時，您總是需要做一些額外的工作。

在這種情況下，由於 docker-compose 是在其 python 腳本中直接調用的，因此您將不得不編寫一個具有等效奇點命令的等效腳本。 它們非常好，可以打印出您需要修改的完整 docker 命令。 在這之間，Docker 文檔和關於奇異性和 docker的文檔，你應該有你需要的。