SHACL SPARQLTarget 未驗證 SPARQL 查詢 output 個節點

Question

我有一個帶有 sh:SPARQLTarget 的 NodeShape。 我嘗試在本體編輯器中運行 Target SPARQL 查詢並提供了結果，但是當我在 sh:select 中的自定義目標節點形狀中執行相同的查詢時，它不會驗證 SPARQL 查詢返回的目標節點. 我正在使用 pySHACL。 我做錯什么了嗎？ 我沒主意了。 這是我的節點形狀和數據圖：

我在 sh:select 中使用了“”而不是“””“”，因為我在 python 代碼中將 shapes_graph 定義為變量，並且它已經編碼為“””“””。 我還在 pyShacl 中啟用了 meta_shacl=True 以確保我的 shapes_graph 有效。 此外，nodeShape (snomed:dob363698007Shape) 在提供普通 TargetClass 或 TargetNode 時也能正常工作。 我錯過了什么？

我已經提到SPARQLRule 沒有構建

**NodeShape**

snomed: 
    sh:declare [
        sh:prefix "snomed" ;
        sh:namespace <http://localhost:8890/snomed/> ; 
    ] .
    
snomed:dob363698007Shape
    a sh:NodeShape ;
    sh:target [
        a sh:SPARQLTarget ;
        sh:prefixes snomed: ;
        sh:select "SELECT ?this WHERE { ?node a snomed:24078009.?node a snomed:dob .?node snomed:609096000 ?this.?this a  snomed:dob363698007 .bind(?node as ?conceptName).bind(?this as ?RGName) .FILTER(REGEX(strafter(xsd:string(?RGName),'snomed/'),strafter(xsd:string(?conceptName),'snomed/')) ).}";
        ] ;
    sh:property [
        sh:path snomed:363698007;
        sh:minCount 1;
    ].```

**Data Graph**

```snomed:dob a rdfs:Class,snomed:dob ;
       rdfs:label "Semantic Pattern dob"^^xsd:string ;
        snomed:609096000 snomed:dob363698007 .

    snomed:dob363698007 a rdfs:Class,snomed:dob363698007;
       snomed:363698007 snomed:123037004 .  

    
    snomed:24078009 a rdfs:Class, snomed:24078009, snomed:dob;
        rdfs:label "Gangosa of yaws (disorder)"^^xsd:string ;
        snomed:609096000 snomed:24078009_3,snomed:24078009_5,snomed:24078009_6;
        rdfs:subClassOf snomed:128349005,
            snomed:140004,
            snomed:177010002,
            snomed:312118003,
            snomed:312129004,
            snomed:312422001,
            snomed:363166002,
            snomed:47841006,
            snomed:88037009 .

    snomed:24078009_3 a rdfs:Class, snomed:24078009_3, snomed:dob363698007 ;
        snomed:263502005 snomed:90734009 .

    snomed:24078009_5 a rdfs:Class, snomed:24078009_5,snomed:dob363698007;
        snomed:116676008 snomed:110435003 ;
        snomed:246075003 snomed:6246005 ;
        snomed:363698007 snomed:71836000 ;
        snomed:370135005 snomed:441862004 .

    snomed:24078009_6 a rdfs:Class, snomed:24078009_6,snomed:dob363698007 ;
        snomed:116676008 snomed:110435003 ;
        snomed:246075003 snomed:6246005 ;
        snomed:363698007 snomed:72914001 ;
        snomed:370135005 snomed:441862004 .

Answer 1

我已將您的 shacl 形狀文件和數據圖放入 PySHACL 中以隔離您遇到的問題。

我發現您給定的設置有兩個問題。

首先， SPARQL-Based Targets是SHACL Advanced Specification的一個特性。 PySHACL 默認不啟用 Advanced-Spec 功能。 您可以通過將advanced=True傳遞給驗證模塊或在命令行工具上傳遞-a或--advanced來啟用“高級模式”。

這是您的 SPARQL 目標未選擇您期望的節點的主要原因。

接下來，啟用高級模式后，您將看到 PySHACL 在加載 SHACL Shape Graph 時失敗。 那是因為你的前綴命名空間沒有正確聲明。

請參閱規范文檔的 SPARQL 前綴部分中的示例。 規范規定

“sh:namespace 的值是數據類型 xsd:anyURI 的文字。”

您的sh:namespace是 URIRef，而不是文字。 將命名空間聲明更改為以下內容，修復了錯誤。

sh:namespace "http://localhost:8890/snomed/"^^xsd:anyURI ;

我已經使用更正后的形狀圖運行 PySHACL，它按預期工作。

有關完整的工作示例，請參閱此代碼： https://gist.github.com/ashleysommer/a319beeef33973906b76711675b2635c