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如何使用 ggplot2 在 R 中構建包括 6 個組(6 個不同基因的表達水平)和 2 個亞組(對照和癌症)的分組箱線圖

[英]How to construct a grouped boxplot including 6 groups ( expression levels of 6 different genes) and 2 subgroups (Control & Cancer) in R using ggplot2

數據類似於如下所示。 如果有人可以在這種情況下幫助我,將不勝感激。

基因對照表達 癌症表達 BAX 12 34 BID 18 45 PMAIP1 10 24
該圖應在 x 軸上描繪所有候選基因,在 y 軸上描繪每個基因按腫瘤和正常分組的表達水平。 該示例已顯示。 在此處輸入圖像描述

如果您的數據確實具有與我的示例相同的格式,則此代碼應該可以工作:

library(tidyverse)
data <- data.frame(value = rnorm(120, mean = 5),
                   genes = rep(c("A", "B", "C", "D", "E", "F"), each = 20),
                   condition = rep(c("tumor", "normal"), times = 60))

data %>%
  ggplot(aes(x = genes, y = value, fill = condition))+
  geom_boxplot()+
  theme_classic()

使用reprex v2.0.2創建於 2022-09-13

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