解決從 Intel 切換到 Apple Silicon 后安裝 R 軟件包的問題

Question

我剛剛將舊 Mac 遷移到新 Mac（Intel 到 Apple Silicon），安裝了最新版本的 R，運行brew upgrade ，並開始更新 R 軟件包。 許多需要重新安裝，有些來自源代碼。 我遇到了幾個問題。

1. 找不到庫鏈接（例如， Mac OS Big Sur R 編譯錯誤：ld: framework not found CoreFoundation ）
2. 對於 CRAN 包，在奇怪的 X11 GUI window 中彈出 CRAN 鏡像選擇，而不是在 R 控制台中彈出數字選擇（這是以前的行為）。

我真的不想解決每個庫問題。 我覺得~/.R/Makevars和~/.Rprofile可能需要編輯。 我需要做什么才能解決這些問題 go？

Answer 1

一些資源很有幫助，但有些資源似乎已過時或不完整。 這是我嘗試對我認為有效的方法進行完整的逐步重現，我將在啟動和運行新系統時根據需要進行編輯。

主要基於此處的建議，我按如下方式編輯了 Makevars 文件：

在 shell 中：

vi ~/.R/Makevars

然后我點擊i （用於插入）並刪除了那里的所有內容。 然后我補充說：

LDFLAGS += -L/opt/homebrew/opt/libomp/lib
CPPFLAGS += -I/opt/homebrew/opt/libomp/include
FLIBS   =-L/opt/homebrew/opt/gfortran/lib
F77     = /opt/homebrew/bin/gfortran
FC      = /opt/homebrew/bin/gfortran

CFLAGS   = -I/opt/homebrew/include
CPPFLAGS = -I/opt/homebrew/include
CXXFLAGS = -I/opt/homebrew/include

為了保存，我按了esc ，然后按:x保存並關閉。

AFAIK，這解決了庫查找/加載/鏈接的問題，我現在已經從源代碼安裝了幾個包，沒有錯誤。

為了處理煩人的彈出式 GUI window 到 select CRAN 鏡像，我編輯了~/.Rprofile （也如上所述使用vi ）來閱讀：

local({r <- getOption("repos")
       r["CRAN"] <- "https://cloud.r-project.org"
       options(repos=r)
})

options(menu.graphics = FALSE)

這是基於對這個古老但仍然重要的問題的最佳答案