使用 ggsurvplot 和 survminer 時刪除分層線上的破折號

Question

如何更改性別階層的線型，使其成為一條沒有所有小“十字”的線，如下圖所示？ 我希望得到一條實線。 當有很多數據點時，十字讓事情看起來有點擁擠。

library(survminer)


fit <- survfit( Surv(time, status) ~ sex, data = colon )
ggsurvplot(fit, colon,
                palette = "jco", pval = TRUE)

Answer 1

這些是審查事件，通常期望您將它們顯示在生存曲線上。 如果你真的想擺脫它們（我沒有看到直接在ggsurvplot中執行此操作的選項），你可以在創建繪圖后刪除它們所在的圖層。 這是一個代表：

library(survminer)
library(survival)

fit <- survfit( Surv(time, status) ~ sex, data = colon )
g <- ggsurvplot(fit, colon, palette = "jco", pval = TRUE)

g$plot$layers[[3]] <- NULL

g

^{創建於 2022-12-15，使用reprex v2.0.2}

Answer 2

您可以像這樣將參數censor.shape與 NA 一起使用：

library(survminer)
library(survival)
fit <- survfit( Surv(time, status) ~ sex, data = colon )
ggsurvplot(fit, colon,
           palette = "jco", pval = TRUE,
           censor.shape=NA)

^{創建於 2022-12-15，使用reprex v2.0.2}

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使用一些有用的鏈接檢查此答案。

有關更多信息和選項，請查看文檔中的檢查點部分

Answer 3

你只需要設置censor=FALSE 。

library(survminer)
library(survival) # to obtain the colon dataset

fit <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = colon)
ggsurvplot(fit, colon, censor = FALSE,
           palette = "jco", pval = TRUE)

如果你搜索ggsurvplot的幫助，你會發現有更多參數可以自定義截尾事件：

檢查點

• 審查員：邏輯值。 如果為 TRUE（默認），將繪制檢查器。

• censor.shape ：指定審查點形狀的字符或數值。 默認值為“+”(3)，明智的選擇是“|” （124）。

• censor.size ：指定審查點大小的數值。 默認值為 4.5。