如何在 R 上安裝 install_github 函數？

Question

我正在嘗試使用一個有效示例中的 github 包。 我使用了建議的方法

在這里讓安裝-github工作

library(devtools)
library(httr)
set_config(config(ssl_verifypeer = 0L))
install.packages("install_github")
install_github("ggbiplot", "vqv")

我收到一條警告，將我重定向到R website安裝頁面，然后出現錯誤Error in parse_repo_spec(repo): Invalid git repo specification: 'ggbiplot'

最終，我想運行這段代碼

# Load data
data(iris)
log.ir <- log(iris[, 1:4])
ir.species <- iris[, 5]

#PCA
ir.pca <- prcomp(log.ir,
                 center = TRUE,
                 scale. = TRUE) 
#Plot
g <- ggbiplot(ir.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1, 
              groups = ir.species, ellipse = TRUE, 
              circle = TRUE)
g <- g + scale_color_discrete(name = '')
g <- g + theme(legend.direction = 'horizontal', 
               legend.position = 'top')
print(g)

Answer 1

您需要user/repo語法來指定 repo，因為 GitHub 上有多個名為ggbiplot的包 - R 包有 157 個分支，您必須告訴 R 您想要哪個：

library(devtools)

install_github('vqv/ggbiplot')
#> Downloading GitHub repo vqv/ggbiplot@HEAD

library(ggbiplot)

現在我們可以運行您的代碼：

data(iris)
log.ir <- log(iris[, 1:4])
ir.species <- iris[, 5]

#PCA
ir.pca <- prcomp(log.ir,
                 center = TRUE,
                 scale. = TRUE) 
#Plot
g <- ggbiplot(ir.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1, 
              groups = ir.species, ellipse = TRUE, 
              circle = TRUE)
g <- g + scale_color_discrete(name = '')
g <- g + theme(legend.direction = 'horizontal', 
               legend.position = 'top')
print(g)