如何使用第 1 列的每個唯一值創建一個 slurm 數組，並將第 2 列中的相應值用作 bash 腳本中的輸入

Question

從表中，我試圖將對應於每個唯一組（第 1 列）的文件名（第 2 列）作為輸入傳遞到使用唯一第 1 列變量創建的 slurm 數組中。 我正在做這樣的事情：

樣品表：

$cat table.txt
group1  a.txt
group1  b.txt
group2  c.txt
group2  d.txt
group3  e.txt
group3  f.txt

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#!/bin/bash
#SBATCH --array=0-2
#SBATCH -N 1
#SBATCH -c 8
#SBATCH -t 1-

GRP=`awk '{print $1}' table.txt | uniq`
echo $GRP

XYZ=${GRP[$SLURM_ARRAY_TASK_ID]}
echo $XYZ

INPUT=`awk -v x="$XYZ" '$1 == x {print $2}' table.txt`
echo $INPUT

=================================

所需的 output 這里是數組的每個作業中的兩個文件的列表。 例子：

a.txt
b.txt

問題：使用變量 $XYZ 作為模式不會為 $INPUT 返回任何值，而 $GRP 和 $XYZ 有效。 如果我使用 $GRP 而不是 $XYZ 作為 $INPUT 中的變量，並且在第 1 列中只有一個唯一值，如下所示，它可以工作。

$cat table.txt
group1  a.txt
group1  b.txt

這里的output是a.txt b.txt

如果有人可以幫助在陣列中的個人工作中為每個組獲得類似的 output，我會很感激。

Answer 1

要使 GRP 成為數組，您應該將賦值的右側括在括號中，因此：

GRP=(`awk '{print $1}' table.txt | uniq`)

您所做的只是將 GRP 創建為普通變量，因此${GRP[0]}是整個字符串，所有其他索引將返回空。