python子進程

Question

我通常在Linux（手動）中執行Fortran文件：

1. 連接到服務器
2. 轉到特定文件夾
3. ifort xxx.for -o xxx && ./xxx （其中'xxx.for'是我的Fortran文件，'xxx'是Fortran可執行文件）

但我需要調用蟒蛇（我是初學者）我的Fortran文件（xxx.for），所以我用subprocess用下面的命令：

cmd = ["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

但我得到一個錯誤，我不確定是什么問題。 這是完整的代碼：

import string
import subprocess as subProc
from subprocess import Popen as ProcOpen
from subprocess import PIPE
import numpy
import subprocess

userID = "pear"
serverName = "say4"
workDir = "/home/pear/2/W/fortran/"
Fortrancmd = "ifort"
jobname = "rad.for"
exeFilename = "rad"

sshConnect=userID+"@"+servername

cmd=["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

**#command to execute fortran files in Linux
**#ifort <filename>.for -o <filename> && ./<filename> (press enter)

**#example:ifort xxx.for -o xxx && ./xxx (press enter)

print cmd

如何編寫一個執行上述所有3個步驟的python程序並避免我得到的錯誤？

Answer 1

有一些語法錯誤......

原版的：

cmd=["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

我想你的意思是：

cmd = [
      "ssh",
      sshConnect,
      "cd %s;" % (workDir,),
      "%s %s -o  %s && ./%s" % (Fortrancmd, jobname, exeFilename, exeFilename)
      ]

幾點說明：

• 具有一個元素的元組需要在第一個參數的末尾使用逗號，請將（workDir，）解釋為元組（與簡單的操作順序parens相對）
• 使用單個字符串格式操作構建fortan命令可能更容易

PS - 為了便於閱讀，將長列表分成多行通常是個好主意:)

我的建議

我建議查看此stackoverflow線程的ssh而不是使用子進程

Answer 2

對於手動部分，您可能需要查看pexpect或windows wexpect 。 這些允許您在交互條件下執行子進程並傳遞輸入。

但是，你所做的大部分內容聽起來都像是在shell腳本中運行良好。 為簡單起見，您可以在服務器端為服務器端操作創建一個shell腳本，然后插入ssh語句中的路徑：

ssh user@host "/path/to/script.sh"

Answer 3

你可以使用fabric來完成第1步和第2步。這是基本的想法：

from fabric.api import *
env.hosts = ['host']
dir = '/home/...'

def compile(file):
     with cd(dir):
         run("ifort %s.for -o %s" %(file,file))
         run("./%s > stdout.txt" % file)

• 創建fabfile.py
• 你運行fab compile:filename

Answer 4

一個錯誤：
你的args列表中有一個不帶引號的％s，因此你的字符串格式化會失敗。

Answer 5

下面是一個使用子進程模塊通過ssh運行遠程命令的完整示例（在這種情況下是一個簡單的回聲）並獲取結果，希望它有所幫助：

>>> import subprocess
>>> proc = subprocess.Popen(("ssh", "remoteuser@host", "echo", "1"), stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
>>> stdout, stderr = proc.communicate()

在這種情況下返回：（'1 \\ n'，''）

請注意，要在不需要密碼的情況下使其工作，您可能需要將本地用戶的公鑰添加到遠程計算機上的~remoteuser / .ssh / authorized_keys。

Answer 6

你必須使用python嗎？

ssh user @ host“command”