R項目/包開發的ESS工作流程

Question

任何人都可以在ESS下分享他在R peject開發工作流程方面的經驗嗎？ 我試過幾次學習emacs，但我還沒有得到它。 我可以將ESS理解為編輯器，但ESS中是否有項目視圖？ 什么是設置/查看R項目目錄，編碼和測試的有效方法，以及ESS如何有利於整個過程？

您是僅將ESS用作優秀的R編輯器還是傾向於在ESS中模擬R IDE環境？

感謝您的任何建議。

Answer 1

聽起來你問的是兩個不同的問題。 一個問題涉及工作流程以及使用ESS的其他問題。 當我使用StatET和Eclipse時，我將分享我關於您的問題的工作流程方面的經驗。

和文森特一樣，我也遵循Josh Reich在此提出的工作流程（也參見Hadley的有用評論）： 統計分析和報告撰寫的工作流程

雖然它可以在不同的項目之間變化，但我傾向於有幾個主要的R文件

• import.R：這會導入數據文件並進行任何必要的清理和操作
• analyse.R：這會生成任何最終報告所需的輸出
• main.R：這會調用import.R和analyse.R

目標是import.R和analyse.R表示產生任何分析的最終結果的完整和最終工作流程。

就分析項目的目錄結構而言，我通常也會有以下文件夾

• data ：用於存儲任何原始數據文件
• meta ：用於存儲元數據，例如變量標簽，測試評分系統，重新編碼信息等。
• 輸出 ：用於存儲我的分析生成的任何圖形，表格或文本，我可能希望將其合並到外部程序中
• temp ：在探索數據和頭腦風暴分析時，我喜歡將代碼鍵入文件而不是使用控制台。 我傾向於標記這些temp1.R，temp2.​​R，temp3.R。 我將它們存儲在臨時文件夾中。 這樣我就可以輕松訪問永久記錄。 如果分析成為最終的，它們會被合並到一個主要的R文件中（即import.R或analysis.R）
• 函數 ：如果我認為在幾個項目中需要一個函數，我經常將每個文件中的一個函數或一組相關函數放在一個名為functions的文件夾中的文件中。 當包開發的形式要求超過需要時，這使得跨項目重用功能相對容易。
• library ：如果我想創建一些我認為將特定於項目的常規函數​​，我會將它們放在這個文件夾中
• save ：用於存儲任何已保存R對象的文件夾

使用StatET和Eclipse可以輕松地與這樣的文件系統進行交互。 當然，鑒於所有使用ESS和Emacs的R大師，我確信它也能很好地處理與文件系統的交互。

Answer 2

我不確定你對這個問題的期望是什么。 舉個例子 ，我剛剛偷了（並改編了） 這里建議的系統（Josh Reich） ：

為每個項目創建一個文件夾，並將您的工作分成一堆不同的.R文件：

• Load.R用於將原始數據導入R;
• Prep.R用於清理數據，重新編碼變量等;
• Func.R用於編碼評估所需的任何自定義函數; 和
• Eval.R用於運行最終的東西。

如果這不適合您的風格，只需更改它。

然后，您可以擁有一個主文件，一個接一個地調用每個部分（有利於再現性），或者在不同階段保存，並讓各個腳本加載適當的數據（如果某些准備工作計算量很大，那么這是好的/時間密集）。

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另一方面，在鏈接上發布的技巧確實幫助我進入了ESS。 它將Shift-Enter轉變為一站式ESS商店： http ： //www.kieranhealy.org/blog/archives/2009/10/12/make-shift-enter-do-a-lot-in-ess /

Answer 3

其他人給了你一些關於如何為項目設置目錄/文件結構的好主意。

您還詢問了“項目視圖”，在這種情況下，您可能需要查看Emacs代碼瀏覽器 （ECB）。

你可以在它的網站上找到它的一些屏幕截圖，在這里： http ： //ecb.sourceforge.net/screenshots/index.html