Python迭代字符

Question

我一直試圖在ACGT基因組中提取中值串搜索序列。 我遇到的問題是AAAAAAAA到AAAAAAAC等等，直到我嘗試了所有可能的組合。

通過創建兩個列表，一個包含A，C，G，T和另一個包含8個字符的序列，以及每次搜索迭代和交換字符后，我基本上都在蠻力。 問題是我沒有測試所有組合，因為當兩個迭代同時它跳過一個字母。

有什么方法可以輕松地去AAAAAAAA - AAAAAAAC - AAAAAAAG - AAAAAAAT - AAAAAACA等嗎？

Answer 1

itertools.product("ACGT", repeat=8)

Answer 2

如上所述使用itertools，

itertools.product("ACGT", repeat=8) # will work in your case.

Answer 3

使用pyparsing wiki示例頁面中的正則表達式逆變器，反轉此正則表達式： [ACGT]{8} 。 您也可以在UtilityMill上嘗試在線變頻器，但是這個服務器在生成8個字符的字符串時會超時，但我已經在允許的時間內成功獲得了6個字符。