Reg ex - 找到字符串的一部分

Question

我有這種類型的數據（重復多次）：

@@@FFDFFHHHHHJJFFHGIJJJJGI   
@M00332:5:000000000-A0TVJ:1:1:13498:26189 2:N:0:1   
ACCACAGCCGCTGCCCATTTGCATAA 
+

使用正則表達式我試圖選擇包含特定字符串cagccgctgcccatttg所有行。 我是一個正則表達式的新手，所以我試過這個： \\w{3,}(cagccgctgcccatttg)\\w{3,}

任何幫助深表感謝。

干杯西蒙

Answer 1

根據我的理解，您希望收集包含單個子序列的所有序列。 我不知道你正在使用什么環境，但是這應該以非常簡單的方式返回你正在尋找的任何序列。

([ACGT]{3,}CAGCCGCTGCCCATTTG[ACGT]{3,})

括號是一個字符類，這意味着它匹配內部的任何單個字符。 你不想匹配\\ w，你只想匹配一個角色，如果它是你正在尋找的4個角色之一。 此外，您可以使用parens覆蓋整個正則表達式以獲取整個匹配。