ggplot2 0.9.3 的異常行為

Question

此代碼在ggplot2 0.9.3中無法正常工作（與ggplot2 0.9.3早期版本一起工作正常，請參見此處）。 這個問題有解決方法嗎？

library(ggplot2)
p <- qplot(as.factor(dose), len, data=ToothGrowth, geom = "boxplot", color = supp) + theme_bw()
p <- p + labs(x="Dose", y="Response")
p <- p + stat_summary(fun.y = mean, geom = "point", color = "blue", aes(group=supp))
p <- p + stat_summary(fun.y = mean, geom = "line", aes(group = supp))
p <- p  + theme(axis.title.x = element_text(size = 12, hjust = 0.54, vjust = 0))
p <- p  + theme(axis.title.y = element_text(size = 12, angle = 90,  vjust = 0.25))
print(p)

編輯

這條線

p <- p + stat_summary(fun.y = mean, geom = "line", aes(group = supp))

產生以下警告

geom_path：每組只包含一個觀察。 你需要調整群體審美嗎？

Answer 1

這種行為是 ggplot2 0.9.3 中的一個錯誤： https : //github.com/hadley/ggplot2/issues/739

您可以通過使用 ddply 計算摘要來解決它：

library(plyr)
tg <- ddply(ToothGrowth, c("dose", "supp"), summarise, len = mean(len))

library(ggplot2)
ggplot(ToothGrowth, aes(x=as.factor(dose), y=len, colour=supp)) +
    geom_boxplot() +
    geom_line(data=tg, aes(group=supp))