簡體   English   中英

bash通過匹配列來合並文件

[英]bash merge files by matching columns

我有兩個文件:

 File1

 12    abc
 34    cde
 42    dfg
 11    df
 9     e   


 File2

 23    abc
 24    gjr
 12    dfg
 8     df

我希望逐列合並文件(如果第2列相同),輸出如下:

  File1  File2
   12    23    abc
   42    12    dfg
   11    8     df
   34    NA    cde
   9     NA    e
   NA    24    gjr

我怎樣才能做到這一點?

我試過這樣的:

 cat File* >> tmp; sort tmp | uniq -c | awk '{print $2}' > column2; for i in
 $(cat column2); do grep -w "$i" File*

但這是我被困的地方......
不知道如何在greping之后我應該逐列組合文件並寫入缺少值的NA。

希望有人可以幫助我。

由於我使用bash 3.2運行為sh (沒有進程替換為sh ),我使用了兩個臨時文件來准備好與join一起使用的數據:

$ sort -k2b File2 > f2.sort
$ sort -k2b File1 > f1.sort
$ cat f1.sort
12    abc
34    cde
11    df
42    dfg
9     e  
$ cat f2.sort
23    abc
8     df
12    dfg
24    gjr
$ join -1 2 -2 2 -o 1.1,2.1,0 -a 1 -a 2 -e NA f1.sort f2.sort
12 23 abc
34 NA cde
11 8 df
42 12 dfg
9 NA e
NA 24 gjr
$

通過進程替換,您可以編寫:

join -1 2 -2 2 -o 1.1,2.1,0 -a 1 -a 2 -e NA <(sort -k2b File1) <(sort -k2b File2)

如果您希望數據格式不同,請使用awk對輸出進行后處理:

$ join -1 2 -2 2 -o 1.1,2.1,0 -a 1 -a 2 -e NA f1.sort f2.sort |
> awk '{ printf "%-5s %-5s %s\n", $1, $2, $3 }'
12    23    abc
34    NA    cde
11    8     df
42    12    dfg
9     NA    e
NA    24    gjr
$

暫無
暫無

聲明:本站的技術帖子網頁,遵循CC BY-SA 4.0協議,如果您需要轉載,請注明本站網址或者原文地址。任何問題請咨詢:yoyou2525@163.com.

 
粵ICP備18138465號  © 2020-2024 STACKOOM.COM