R中帶有mcp（）（最小凸多邊形）的可疑家庭范圍值
[英]questionable home range values with mcp() (minimum convex polygon) in R
我正在嘗試計算整個物種的家庭范圍，並根據性別將兩組分開。 我使用了 mcp() 並且它運行但輸出有問題。 這是我的數據 這部分應該沒問題，因為我檢查了 longlat 到 UTM 的轉換，並且坐標確實與正確的 UTM 值相對應。 因此，我認為問題在於下一部分： 當我繪制數據點時，它們看起來 ...
從空間像素數據幀轉換為 estUD
[英]Convert from spatialpixeldataframe to estUD
簡而言之：我有一個動物在網格（udspdf）上的利用率分布的空間像素數據框，我需要將其轉換為 estUD 類。 我如何到達那里的背景：在計算了單個動物的 KDE 之后，我需要將 estUD 類對象轉換為空間像素數據幀以移除非棲息地單元，並將棲息地單元的利用率分布重新調整為 1 . 然后我需要將 s ...
嘗試在 R 中將空間多邊形導出為 shapefile 時 writeOGR 出錯
[英]Error in writeOGR when trying to export spatial polygons as shapefile in R
我正在嘗試導出我為家庭范圍數據創建的多邊形，但是當我 go 導出它們時收到此錯誤消息： 我沒有任何運氣來尋找這個問題的答案，我的目標是為家庭范圍創建多邊形，然后將它們導出為要在 QGIS 中使用的 shapefile。 ...
如何使用 package adehabitatHR 計算家庭范圍分析的 KUD？
[英]How to calculate KUD for home range analysis using the package adehabitatHR?
我正在嘗試為我的企鵝跟蹤數據計算 KUD 50% 和 95%，但遇到了錯誤。 我的目標是計算家庭范圍密度，然后將數據導出為多邊形。 運行這部分腳本后發生錯誤，tracks.utm[,X] 表示數據排序的列，它是按單獨的tripID，因此它應該為每個單獨的軌道創建一個范圍。 錯誤： 我懷疑我的腳本中 ...
“kernelUD 中的錯誤：至少需要 5 次重定位才能適應一個主范圍”，但每組有超過 5 次重定位
[英]“Error in kernelUD: At least 5 relocations required to fit a home range” but have many more than 5 relocations per group
我一直在按人口和每包跨各種時間尺度對一個地區的犬科動物群體進行 kernel 密度家庭范圍估計。 但是，當我嘗試在每年的一個子集上運行 kernelUD 時，我Error in kernelUD(P17.sp[, "Pack"], h = "href", grid = 500, same4all = ...
使用核密度計算 HR。 電網問題？
[英]Computing HR using Kernel Density. Grid issues?
我的數據集包括動物位置和 id。 我想要做的是我正在嘗試使用核密度函數計算 Home Range。 由於我的數據集很大，我嘗試將數據集分成兩部分。 每個數據集有 99586 個觀測值，其中包括 190 個唯一 ID。 因此，我無法生成可重現的數據集。 當我嘗試使用 kernelUD 函數時，我 ...
在 R 中子設置空間點數據框
[英]Sub-setting a spatial point data frame in R
我正在嘗試使用 function 子集對空間點數據框進行子集化，如下所示： 我期待得到名為“Chou”的個人的所有行，但相反，我得到了一個空列表。 顯然我做錯了，會得到一些幫助。 謝謝！ 伊丹 ...
為什么 SpatialPointsDataFrame 四舍五入我的 Y 坐標？ （將 UTM 5252636 舍入到 5262640）
[英]Why is SpatialPointsDataFrame rounding my Y coordinates? (rounds UTM 5252636 to 5262640)
我正在嘗試使用 adehabitatHR 使用遙測數據來估計家庭范圍的大小。 每次我創建 SpatialPointsDataFrame 時，它都會舍入我的 UTM 位置的 y 坐標。 我曾嘗試將 UTM 保存為整數、數字、在導入 .csv 之前刪除 NA、在導入 .csv 之后刪除 NA、作為 ...
將輪廓核密度估計圖導出為柵格或 shapefile 格式
[英]Exporting a contoured Kernel density estimation plot to raster or shapefile format
我正在嘗試使用我擁有的一些 GPS 數據在 R 中執行內核密度估計。 我的目標是創建一個輪廓輸出，每行代表 KDE 的 10%。 從這里我想將輸出（作為 shapefile 或柵格）導入 QGIS 或 arcmap，以便我可以將輸出覆蓋在現有環境圖層的頂部。 到目前為止，我已經使用 Adehabi ...
adehabitatLT 中的首次通過時間分析僅返回 NA
[英]First Passage Time analysis in adehabitatLT returns only NA
背景：我嘗試使用adehabitatLT在 R 中進行首次通過時間分析。 我在這里找到了一個很好的教程，我可以使用我自己的數據集來執行所有步驟，這些數據設置到第一次通過時間分析部分。 問題：當我使用fpt()命令時，我得到一個奇怪的結果，其中所有生成的列表都用NA填充（除了我自定義的半徑列表，我測 ...
如何計算布朗橋運動模型的面積？
[英]How do I calculate the area of a Brownian bridge movement model?
在adehabitatHR包中有一些示例代碼可以使用kernelbb函數計算野豬的布朗橋運動模型。 我想計算結果的對象的面積。 我也想知道該地區的單位。 我認為 NTF（巴黎）/蘭伯特區 III”，EPSG 代碼 27573，是 CRS。 這是代碼： ...
計算50％和95％的kde以確定基准范圍的核心和外圍區域
[英]Calculating 50% and 95% kde to determine core and periphery areas of home ranges
我有5只動物的GPS位置。 我正在嘗試計算50％和95％的內核分布，以確定核心和外圍區域的大小（以km2為單位）（作為表格），我還想繪制這些數據的輪廓（50％和95％）。 有人可以提供代碼幫助嗎？ 加載所需的軟件包后，我已經可以使用下面的代碼生成柵格圖像，但是不能生成這些區域的輪廓或大 ...
在 compana 中用較小的值（即 0001）替換零值時，有沒有辦法獲得一致的結果？
[英]Is there a way to get consistent results when replacing zero values with smaller values (ie. 0001) in compana?
我正在使用compana package 中的Adehabitat來確定是否從可用棲息地中選擇了已使用的棲息地。 我在可用矩陣中使用的棲息地類別之一有幾個非常低的值（即0.000015000 ）或零值。 因此，當我用更大的值 ( 0.001 ) 替換 R 代碼中的任何零值時，它會影響我的結果。 當 ...
為adehabitatHR中的多個動物創建內核密度估計
[英]creating kernel density estimates for multiple animals in adehabitatHR
我正在嘗試創建內核密度估計（KDE），以估計多對長尾山雀的原始范圍。 盡管濾除了少於五個GPS位置的對（“ nest_id”變量），但在嘗試為所有個人創建kernelUD時，我仍然收到錯誤消息“至少需要5個重定位才能容納原始范圍”。 我不確定到底是什么問題/我在做什么錯。 我對家庭范圍分析 ...
R代碼adehabitatHR-網格對於內核UD / getverticeshr / adehabitatHR主范圍估計而言太小
[英]R Code adehabitatHR - Grid too small for kernelUD /getverticeshr/adehabitatHR home range estimation
對不起，我的新手問題。 我仍在學習如何在R中進行空間分析。我意識到這個問題以前曾被提出過（ 在此 ）。 目標 ：我無法在專門針對我的經度（X）值的參數內使用模擬數據運行此代碼（請參見第24行）。 我想用模擬數據繪制家庭范圍（如下）。 錯誤 ：“ getverticeshr.est ...
adehabitatHR locoh.k 孤兒洞
[英]adehabitatHR locoh.k orphan holes
我正在嘗試使用AdehabitatHR LoCoH.k.area優化 k 參數，並且當拓撲無法生成多邊形時它會停止運行。 訊息是： rgeos_PolyCreateComment：孤立孔，在索引 12 處找不到孔的包含多邊形。 我已經使用 LoCoH.k 完成了許多成功的單次運行，只有少 ...
R 中的矢量加法（減法）用於運動路徑
[英]Vector addition (subtraction) in R for movement paths
我有一個數據框，其中包含動物在緯度/經度坐標中的運動路徑。 由此我推導出速度和對地方位。 數據幀還包含相對於動物位置的風向量，即在時間 t 時風相對於動物的速度和方位。 我想使用矢量加法來計算動物在空氣中的運動（而不是相對於地面），以便計算動物必須遵循的運動矢量，以便在給定風的情況下產生它的地理 ...
將 khrud 對象從 kernelUD 導出到光柵
[英]export khrud object from kernelUD to raster
在 R 中，如何將 adehabitat 包中的函數 kernelUD 中的 khrud 對象導出到光柵文件（geoTiff）？ 我嘗試使用此處的代碼關注此線程（ R：如何從 estUDm 對象創建柵格圖層）： 其中 udbis1 是一個 khrud 對象，但我得到“as(udbis1, "S ...
查看設計II的個人選擇率
[英]Viewing design II individual selection ratios
我一直在使用R包adehabitat來計算我正在研究的，涉及動物覓食棲息地偏好的項目的選擇比率。 當使用功能widesII我可以看到我放入該功能的每只動物的widesII （平均）選擇率，但看不到每個個體的選擇率。 但是，如果我繪制選擇比率函數，它將顯示這些單個選擇比率的折線圖。 ...
為R中MCP的最小位置數子集，刪除單個名稱
[英]Subsetting for a minimum number of locations for MCP in R, dropping individual names
我有一個與此處發布的問題非常類似的問題： 在R中為MCP的最小位置數設置子集 這是基於每組的行數的子集數據幀 在我嘗試對數據集進行子集刪除的情況下，該數據集刪除了少於5個觀察值的所有個體。 df <-data.frame（name = c（“ a”，“ a”，“ a”，“ ...