如何使用 bigstatsr R package 使用兩個數據集來估計參數？
[英]How to use the bigstatsr R package using two datasets for estimating the parameters?
我有獨立和依賴的數據集。 我想測試因變量和自變量之間所有可能的關系。 在我之前的帖子（ 如何使用帶有多個 arguments 的 mapply 復制 function 來計算方法的功效？ ）中，我想使用仿真數據進行功效分析。 現在，我想使用相同的 function 分析真實數據。 問題是test_ ...
如何使用 sqlite 數據庫填充 bigstatsr::FBM 以供以后使用？
[英]How to populate bigstatsr::FBM with sqlite database for later consumption?
我是 bigstatsr package 的新手。 我有一個 sqlite 數據庫，我想將其轉換為 40k 行（基因）60K 列（樣本）的 FBM 矩陣供以后使用。 我找到了如何用隨機值填充矩陣的示例，但我不確定用我的 sqlite 數據庫中的值填充矩陣的最佳方法是什么。 目前我按順序執行，這里有 ...
big_cprodMat輸出問題：矩陣太大
[英]Problem with big_cprodMat output: Matrix too large
我正在嘗試獲取R中兩個“大矩陣”的叉積。不幸的是，此處無法公開數據，但是尺寸為177304 * 23和23 * 177304，因此結果應為尺寸177304 * 177304。 因為我的RAM是8 GB，所以我一直在使用FBM類將矩陣存儲在磁盤存儲空間中。 但是，當我使用函數big_cpr ...
bigstatsr的FBM（）在使用並行foreach時無法正確計算矩陣，就像在簡單的for循環中運行代碼時一樣
[英]FBM() of bigstatsr does not calculate the matrix correctly while using parallel foreach as it does when the code is running in a simple for loop
我需要估計一個轉移矩陣。 因為我有很多數據，所以我嘗試使用foreach並行運行它，並嘗試了bigstatsr的共享內存函數FBM() 。 而且似乎該功能並非始終都能返回正確的結果。 （有時是。）功能是否可能無法正常工作？ 這是代碼正常運行的示例： 這是不總是返回正確結果的代 ...
將 bigstatsr::FBM 轉換為矩陣？
[英]Convert bigstatsr::FBM to matrix?
是否可以將bigstatsr::FBM對象轉換為常規 R 矩陣？ 例如，假設我生成以下矩陣： N <- 100 K <- 50 `%dopar%` <- foreach::`%dopar%` `%:%` <- foreach::`%:%` mat3 <- bigsta ...
將來自嵌套的foreach循環的結果存儲在FBM類中
[英]store results from a nested foreach loop in a FBM class
我正在foreach循環中使用1.3e6x1.3e6的大型共享內存矩陣。 我使用bigstatsr軟件包的FBM函數創建該矩陣。 我需要FBM類對象中的循環結果不耗盡RAM內存。 這是我要在沒有FBM類對象的情況下要做的事情。 這就是我嘗試的方式 PS：有人可以添加標簽“ ...
如何在 Rcpp 中對 bigstatsr::FBM 的行或列進行子集化並將它們存儲在向量中？
[英]How can I subset rows or columns of a bigstatsr::FBM in Rcpp and store them in a vector?
我有一個函數可以從給定矩陣的行（或列）計算基本匯總統計數據，我現在正嘗試將此函數與 bigstatsr::FBM 一起使用（我知道使用列應該更有效）。 我想將行/列存儲在向量中的原因是我想用 std::nth_element 計算分位數。 如果在沒有向量的情況下有不同的方法來做到這一點，我會同樣高興 ...