cost 319 ms
R中带有mcp()(最小凸多边形)的可疑家庭范围值 - questionable home range values with mcp() (minimum convex polygon) in R

我正在尝试计算整个物种的家庭范围,并根据性别将两组分开。 我使用了 mcp() 并且它运行但输出有问题。 这是我的数据 这部分应该没问题,因为我检查了 longlat 到 UTM 的转换,并且坐标确实与正确的 UTM 值相对应。 因此,我认为问题在于下一部分: 当我绘制数据点时,它们看起来 ...

从空间像素数据帧转换为 estUD - Convert from spatialpixeldataframe to estUD

简而言之:我有一个动物在网格(udspdf)上的利用率分布的空间像素数据框,我需要将其转换为 estUD 类。 我如何到达那里的背景:在计算了单个动物的 KDE 之后,我需要将 estUD 类对象转换为空间像素数据帧以移除非栖息地单元,并将栖息地单元的利用率分布重新调整为 1 . 然后我需要将 s ...

尝试在 R 中将空间多边形导出为 shapefile 时 writeOGR 出错 - Error in writeOGR when trying to export spatial polygons as shapefile in R

我正在尝试导出我为家庭范围数据创建的多边形,但是当我 go 导出它们时收到此错误消息: 我没有任何运气来寻找这个问题的答案,我的目标是为家庭范围创建多边形,然后将它们导出为要在 QGIS 中使用的 shapefile。 ...

如何使用 package adehabitatHR 计算家庭范围分析的 KUD? - How to calculate KUD for home range analysis using the package adehabitatHR?

我正在尝试为我的企鹅跟踪数据计算 KUD 50% 和 95%,但遇到了错误。 我的目标是计算家庭范围密度,然后将数据导出为多边形。 运行这部分脚本后发生错误,tracks.utm[,X] 表示数据排序的列,它是按单独的tripID,因此它应该为每个单独的轨道创建一个范围。 错误: 我怀疑我的脚本中 ...

“kernelUD 中的错误:至少需要 5 次重定位才能适应一个主范围”,但每组有超过 5 次重定位 - “Error in kernelUD: At least 5 relocations required to fit a home range” but have many more than 5 relocations per group

我一直在按人口和每包跨各种时间尺度对一个地区的犬科动物群体进行 kernel 密度家庭范围估计。 但是,当我尝试在每年的一个子集上运行 kernelUD 时,我Error in kernelUD(P17.sp[, "Pack"], h = "href", grid = 500, same4all = ...

使用核密度计算 HR。 电网问题? - Computing HR using Kernel Density. Grid issues?

我的数据集包括动物位置和 id。 我想要做的是我正在尝试使用核密度函数计算 Home Range。 由于我的数据集很大,我尝试将数据集分成两部分。 每个数据集有 99586 个观测值,其中包括 190 个唯一 ID。 因此,我无法生成可重现的数据集。 当我尝试使用 kernelUD 函数时,我 ...

为什么 SpatialPointsDataFrame 四舍五入我的 Y 坐标? (将 UTM 5252636 舍入到 5262640) - Why is SpatialPointsDataFrame rounding my Y coordinates? (rounds UTM 5252636 to 5262640)

我正在尝试使用 adehabitatHR 使用遥测数据来估计家庭范围的大小。 每次我创建 SpatialPointsDataFrame 时,它​​都会舍入我的 UTM 位置的 y 坐标。 我曾尝试将 UTM 保存为整数、数字、在导入 .csv 之前删除 NA、在导入 .csv 之后删除 NA、作为 ...

将轮廓核密度估计图导出为栅格或 shapefile 格式 - Exporting a contoured Kernel density estimation plot to raster or shapefile format

我正在尝试使用我拥有的一些 GPS 数据在 R 中执行内核密度估计。 我的目标是创建一个轮廓输出,每行代表 KDE 的 10%。 从这里我想将输出(作为 shapefile 或栅格)导入 QGIS 或 arcmap,以便我可以将输出覆盖在现有环境图层的顶部。 到目前为止,我已经使用 Adehabi ...

adehabitatLT 中的首次通过时间分析仅返回 NA - First Passage Time analysis in adehabitatLT returns only NA

背景:我尝试使用adehabitatLT在 R 中进行首次通过时间分析。 我在这里找到了一个很好的教程,我可以使用我自己的数据集来执行所有步骤,这些数据设置到第一次通过时间分析部分。 问题:当我使用fpt()命令时,我得到一个奇怪的结果,其中所有生成的列表都用NA填充(除了我自定义的半径列表,我测 ...

计算50%和95%的kde以确定基准范围的核心和外围区域 - Calculating 50% and 95% kde to determine core and periphery areas of home ranges

我有5只动物的GPS位置。 我正在尝试计算50%和95%的内核分布,以确定核心和外围区域的大小(以km2为单位)(作为表格),我还想绘制这些数据的轮廓(50%和95%)。 有人可以提供代码帮助吗? 加载所需的软件包后,我已经可以使用下面的代码生成栅格图像,但是不能生成这些区域的轮廓或大 ...

在 compana 中用较小的值(即 0001)替换零值时,有没有办法获得一致的结果? - Is there a way to get consistent results when replacing zero values with smaller values (ie. 0001) in compana?

我正在使用compana package 中的Adehabitat来确定是否从可用栖息地中选择了已使用的栖息地。 我在可用矩阵中使用的栖息地类别之一有几个非常低的值(即0.000015000 )或零值。 因此,当我用更大的值 ( 0.001 ) 替换 R 代码中的任何零值时,它会影响我的结果。 当 ...

为adehabitatHR中的多个动物创建内核密度估计 - creating kernel density estimates for multiple animals in adehabitatHR

我正在尝试创建内核密度估计(KDE),以估计多对长尾山雀的原始范围。 尽管滤除了少于五个GPS位置的对(“ nest_id”变量),但在尝试为所有个人创建kernelUD时,我仍然收到错误消息“至少需要5个重定位才能容纳原始范围”。 我不确定到底是什么问题/我在做什么错。 我对家庭范围分析 ...

R代码adehabitatHR-网格对于内核UD / getverticeshr / adehabitatHR主范围估计而言太小 - R Code adehabitatHR - Grid too small for kernelUD /getverticeshr/adehabitatHR home range estimation

对不起,我的新手问题。 我仍在学习如何在R中进行空间分析。我意识到这个问题以前曾被提出过( 在此 )。 目标 :我无法在专门针对我的经度(X)值的参数内使用模拟数据运行此代码(请参见第24行)。 我想用模拟数据绘制家庭范围(如下)。 错误 :“ getverticeshr.est ...

adehabitatHR locoh.k 孤儿洞 - adehabitatHR locoh.k orphan holes

我正在尝试使用AdehabitatHR LoCoH.k.area优化 k 参数,并且当拓扑无法生成多边形时它会停止运行。 讯息是: rgeos_PolyCreateComment:孤立孔,在索引 12 处找不到孔的包含多边形。 我已经使用 LoCoH.k 完成了许多成功的单次运行,只有少 ...

R 中的矢量加法(减法)用于运动路径 - Vector addition (subtraction) in R for movement paths

我有一个数据框,其中包含动物在纬度/经度坐标中的运动路径。 由此我推导出速度和对地方位。 数据帧还包含相对于动物位置的风向量,即在时间 t 时风相对于动物的速度和方位。 我想使用矢量加法来计算动物在空气中的运动(而不是相对于地面),以便计算动物必须遵循的运动矢量,以便在给定风的情况下产生它的地理 ...

查看设计II的个人选择率 - Viewing design II individual selection ratios

我一直在使用R包adehabitat来计算我正在研究的,涉及动物觅食栖息地偏好的项目的选择比率。 当使用功能widesII我可以看到我放入该功能的每只动物的widesII (平均)选择率,但看不到每个个体的选择率。 但是,如果我绘制选择比率函数,它将显示这些单个选择比率的折线图。 ...

为R中MCP的最小位置数子集,删除单个名称 - Subsetting for a minimum number of locations for MCP in R, dropping individual names

我有一个与此处发布的问题非常类似的问题: 在R中为MCP的最小位置数设置子集 这是基于每组的行数的子集数据帧 在我尝试对数据集进行子集删除的情况下,该数据集删除了少于5个观察值的所有个体。 df <-data.frame(name = c(“ a”,“ a”,“ a”,“ ...


 
粤ICP备18138465号  © 2020-2024 STACKOOM.COM