cost 292 ms
Slurm + drake:空闲作业数组工作者的免费资源用于动态分支 - Slurm + drake: free resources of idle job array workers for dynamic branching

编辑:在发现所描述的行为不是源于 SLURM 而是源于 R package {drake} 后,对问题标题和标签进行了调整,后者用作执行 SLURM 数组作业的代理。 我有以下情况: 一个n=70的 Slurm 作业数组,每个作业有 X CPU 和 Y Mem 120个任务要运行每个任务需要相同的 ...

Drake 仅在某些情况下缺少来自静态分支的依赖项 - Drake is missing dependencies from a static branch only in some cases

我有一个像下面这样的一般形式的计划我的真实计划更复杂,我无法在玩具示例中重现此错误。 有没有人看到过这样的问题,你对可能导致它的原因有什么想法吗? 该计划采用一组模型结果,为每个结果生成一些图表和报告的摘要。 目标 dep1_a-c 和 dep2_a-c 已生成,但图中出现 dep2 dep2_ ...

如何在 R drake 中组合和过滤动态文件目标? - How to combine and filter dynamic file targets in R drake?

我在我的德雷克计划中创建了一组文件。 我想将这些文件的一个子集复制到另一个位置。 下面的代码几乎实现了这一点。 但是,在获取我要复制的文件目标子集后,德雷克对文件更改的依赖关系跟踪丢失了。 如何在不丢失 drake 依赖项跟踪的情况下组合/子集动态文件目标? copy_file <- fu ...

使用带有 drake 的导入包 - Using the import package with drake

了解drake软件包是 R 用户最近的最佳发现之一。 但是,我在可重复性方面看到该包的一个缺点是工作区的功能混乱,而这些功能仅仅是辅助功能。 没有人知道这些source d 函数是否冲突,或者library调用的顺序是否重要。 我知道有conflicted包,但它只处理包。 我知道 R 中的代码单 ...

随着输入的增加,德雷克计划的工作流程 - Workflow for drake plan with increasing input

我有一个 drake 计划,它使用带有file_in的输入文件夹。 然后读取文件夹中的每个文件并进行一些转换。 最后,它加入了结果。 如果我添加一个新文件,我希望计划中的新计算只应用于这个文件,然后加入到以前的结果中。 然而,该计划的作用是:它检测目标的变化,然后根据该目标重新计算所有目标。 注 ...

跨 R 个项目传输对象的最佳实践是什么? - What is the best practice for transferring objects across R projects?

我想在另一个 git 版本 R 项目中使用在一个 git 版本 R 项目中生成的 R 对象(例如,清理数据)。 具体来说,我有多个 git 版本的 R 项目(持有drake计划),它们为我的论文实验做各种事情(例如,生成材料、导入和清理数据、生成报告/文章)。 理想情况下,特定于实验的项目应该是: ...

如何在 drake 中读取动态文件? - How do I read dynamic files in drake?

我想使用德雷克的动态目标来读取多个文件。 我根据对动态文件工作原理的理解编写了以下计划。 但是,当输入文件更改时,drake 不会正确更新所有目标。 使用drake的动态文件读取文件的正确方法是什么? 换句话说,解决这个问题的file_in()的动态文件版本是什么: 如何从 r-drake 中的多 ...

r windows 上的德雷克文件路径搞砸了 - r drake file paths on windows messed up

我试图用德雷克运行一个项目。 make(plan)运行良好,但在计划的最后一点之后我收到一个错误。 我在 windows 系统上运行(带有\\路径分隔符)。 通常 R 使用/路径约定并处理得很好。 但不知何故,这里的路径搞砸了,我不知道为什么。 这是已知的并且有可用的解决方法吗? 有人知道错误是在 ...

如何从德雷克计划将 shiny 应用程序部署到 shinyapps.io - How to deploy shiny app to shinyapps.io from drake plan

这是关闭循环将应用程序和数据传递到 Shiny 部署 function 的后续问题: 如何在德雷克中使用 shiny 应用程序作为目标我想直接从 Drake 计划部署 Shiny 应用程序,如下所示。 shinyapps.io 的日志显示来自 drake 的“cars_data”未传递到 cu ...

在 Drake 工作流程 R 中清理 memory - Clean up memory in Drake workflow R

我有 package 一个庞大的时间序列工作流程(4273 * 10 模型),每周在德雷克中用于 4273 个时间序列。 最初,我尝试使用寓言 package 创建完整的工作流程。 这对于训练分组 tsibbles 的模型非常方便,但是经过不同的试验后,我在 memory 管理方面遇到了很多问题。 ...

drake R 中多个子计划的最佳实践 - Best practice for multiple subplans in drake R

嗨,我是drake R package 的新手,想听听关于使用子任务管理大型项目的最佳实践的一些意见。 我的项目的简化结构有两个部分:1)数据清理和 2)建模。 它们是级联的,因为我先进行数据清理,然后在开始建模部分时很少返回 go。 我认为手册建议的方法是: 我在上述工作流程中遇到的一个问题是我为 ...


 
粤ICP备18138465号  © 2020-2024 STACKOOM.COM