在 R package factoextra ，使用get_dist可以计算变量之间的距离，如何将结果转换成data.frame 格式？ 谢谢！ 下面的代码返回cannot coerce class '"dist"' to a data.frame ...
我在 R 中使用 prcomp 运行了 PCA，我正在尝试生成一个变量 plot，它具有 1) 变量（箭头）的子集，颜色（黑色）与变量的 rest 不同，2）对这些变量进行排序在绘图之前，黑色箭头不会被任何其他箭头覆盖，以及 3) label 黑色箭头及其 TUXXXX 编号。 这是我的数据的截断版 ...
我是第一次接触 R 的研究生。 我正在尝试从一系列身体测量中制作 PCA 图，标本名称和亚种标签 (BIN) 位于单独的列中。 BIN 列包含每个样本的 BIN ID。 我面临的困难是过滤掉具有某些 BIN 的个人。 我想要的输出是生成一个与下面相同的 PCA 图，但只显示命名的 BIN（“ACZ ...
我目前正在研究一个大型数据集（计数数据与物种 x 样本），我从中执行了 PCA。 我得到的是一大片点云，我想给一个给定的物种着色以显示它在这个云中的位置（物种是我的变量）。 这是它的样子： 我使用包 factoextra，并使用 fviz_pca_var 可视化变量。 有没有办法选择一个特定的 ...
我正在为数据分析和统计学习主题做报告。 问题在于聚类阶段。 我必须找到最佳的集群数量，而且我已经做到了。 但是，当我尝试使用以下 function 显示图表时，它给了我一个错误： if (class(best_nc) == "numeric") print(best_nc) else if (c ...
我希望完成两件事。 我希望能够旋转标签。 fviz_dend function 与ggplot2 theme function 兼容，但我不完全确定如何实现它。 我想更改树状图的线条颜色 - 特别是那些不属于聚类的线条颜色。 我想把黑色改成白色。 知道如何在这个代表上完成它吗？df <- ...
我正在尝试使用 package factoextra 中的fviz_ca_col()在对应分析中更改用于补充列的颜色，但是从默认col.col.sup col.col.sup = "darkred"更改颜色时我似乎没有得到任何响应. 可重现的例子： 生成的 plot 具有默认深红色的补充列"Alte ...
我已经为带有 fviz_cluster 的集群散布 plot 编写了以下脚本。 根据 plot，x 有负值，y 有负值。 根据 head(dots.Mclust) （以及我的彻底分析），没有负值。 这种差异从何而来？ fviz(cluster) 如何更改 plot 上的值？ 是否进行了一些标准化 ...
几周以来，我使用以下脚本生成了一个散点图，其中包含大约 10,000 个（非零，正）数据点。 由于转换的警告，只有少数 (<20) 个数据点未包括在内。 从这周开始，我想做一些基于模型的聚类。 我编写的脚本（见下文）使用相同的数据集（10,000 个非零的正数据点），但由于以下原因而遗漏了 ...
有谁知道如何更改椭圆中颜色的透明度（或 alpha）？ 我只想保留 plot 中的边界线。 我试图模仿这个站点中的代码： http://www.sthda.com/english/wiki/fviz-pca-quick-principal-component-analysis-data-visual ...
我在 factoextra 中使用 fviz_pca_biplot 生成双图。 以下代码提供了我的数据集和双图的示例。 我想 label 点的一个子集，而不是全部。 例如，只有单一属的物种，如桉树。 我无法弄清楚如何，或者即使它是可能的。 任何人都可以提出解决方案吗？ ...
我希望使用 factoextra 包在主成分分析双图上显示观察行名称。 ) 提前致谢 ...
你好，我有一个多元数据集 我对缩放数据执行了 PCA，并使用fviz_pca_biplot()函数来显示双标图。 这是我所做的一个例子： （以 mtcars 为例） “mpg”“cyl”“disp”“hp”“drat”“wt”“qsec”“vs”“am”“gear”“carb” ...
我有一个数据集并想运行 PCA 图。 在此图中，观测值应根据name列 ( habillage = a$name ) 以相同颜色分组。 此外，我希望单个观察显示它在Age方面对应于哪个组。 我发现label = "none"没有显示它，但如果我写label = a$Age没有任何变化。 最后，如 ...
有没有办法在 R 包 FactoExtra 中为fviz_pca_biplot()变量指定形状？ 例如，我有以下代码： 但它使var和ind的形状相同，我希望var的形状不同（形状 15）。 当 geom.var = c("point", "text") 设置为 point 时，参数“poin ...
我是 R 的新手，正在尝试根据行业对一些数据进行聚类。 我了解到 K 均值无法处理因子和分类数据。 我已经从我的数据集中删除了名为“工业”的因素——67 个不同的观察结果，但希望在模型完成后为每个观察结果分配一个标签。 本质上，我希望我的最终结果看起来像样本美国犯罪数据集。 任何帮助将不胜感激。 ...
我试图获得与该函数产生的ggplot基质（有序相异矩阵） fviz_dist从factoextra包。 从我的原始数据中，我使用 dis.cor 生成了一个距离相关矩阵（我需要使用 spearman 相关系数），如下所示： 但是这个矩阵没有排序，所以你不能可视化集群。 然后，使用函数 fvi ...
我是 R 的菜鸟，我正在尝试对一些数据样本进行聚类。 我试过 PCA， 我可以使用新坐标获取完整的元素列表 这很棒，非常适合使用带有 PCA 的第 2 个轴的信息，我在一个轴上有 80% 的可变性，在第二个轴上有 10% 以上的可变性。 考虑到我有 30 个变量，我对结果感到非常自豪……最后 ...
我正在使用fviz_pca_ind来制作 PCA plot 见下文。 我想删除质心但保留不同的 colors 和我用habillage=iris$Species得到的椭圆。 col.ind需要一个向量，其元素数等于行数。 ...
我的数据中有很多人（n = 600）。 我运行 PCA 并想创建一个变量和个体的双图。 我想要根据他们的贡献着色的变量。 这些人来自两组，我想根据两组对点进行着色。 我附上一个小例子。 问题; 如何将行名称 SEBRLE 和 NOOL 着色为红色，其余为黑色 将所有行名分配给 2 个因素 ...