我正在尝试使用 package factoextra 中的fviz_ca_col()在对应分析中更改用于补充列的颜色,但是从默认col.col.sup col.col.sup = "darkred"更改颜色时我似乎没有得到任何响应. 可重现的例子: 生成的 plot 具有默认深红色的补充列"Alte ...
我正在尝试使用 package factoextra 中的fviz_ca_col()在对应分析中更改用于补充列的颜色,但是从默认col.col.sup col.col.sup = "darkred"更改颜色时我似乎没有得到任何响应. 可重现的例子: 生成的 plot 具有默认深红色的补充列"Alte ...
我正在尝试在 WG93 数据集上执行 MJCA,我想看看教育水平如何随着强烈的意见而变化。 问题是我不知道如何从 mjca object 中过滤掉不必要的元素。 也就是说,给定级别名称向量data_mjca$levelnames ,我只想选择那些包含"edu" 、 "1"或"5"的元素。 特别是在下 ...
我不确定 R 中 FactoMineR 库中的 MCA() function 的 output。 例如我想要 10 个组件,所以我运行以下代码: ncp(代表维数)是否给了我 10 个组件? ...
如何对训练和测试数据集进行混合数据因子分析(FAMD)? 通常,要应用 sklearn PCA,使用以下代码: 但是,当我使用王子 package时, .transform()不能应用于测试集。 它给出了如下所示的值错误? ...
我正在重新运行大约 6 个月前编写的 RLQ 和第 4 个角分析。 但是,分析 Q 表时出现错误。 我一直在关注 Stephane Dray 的 (2013) 教程并使用环境表的 dudi.pca(R,6 个站点的 6 个“数字”变量), 用于物种存在表的 dudi.coa(L,6 个站点的 15 ...
我已经阅读了 package adjustText在避免 label 重叠方面的效率,我想使用以下由prince创建的图表: 这是创建图像的代码: 在我能找到的所有adjustText示例中,总是可以直接访问标签的坐标。 在这种情况下如何访问标签的坐标? 如何将adjust_text应用于此图? ...
我正在尝试在 R 中使用对应分析。 似乎 FactoMineR 中 function "CA" 的第一个参数必须是列联表。 “dt”是一个列联表,但它返回变量不是定量的。 X1的一个level是空的,不知道是不是Correspondence Analysis的问题 output 是: ...
我试图使用get_mca_ind()函数从FactoExtra解压到在每个维度个人捐款MCA (从FactoMiner包),这样我可以在进一步的分析中使用它。 无需获取所有维度的信息,而是可以确定前5个维度,因此我可以确定需要多少维度(使用scree plot或其他阈值)。 #this sh ...
我正在对从考古现场报告中提取的分类频率数据进行对应分析。 我之所以选择CA,是因为据我所知,它可以处理存在/不存在的情况,这通常是考古数据的本质。 我使用FactoMineR和factoextra包创建了第一维和第二维的漂亮双目图。 但是,查看特征值百分比,我真的很想将第三个维度与前两个维 ...
我是生物信息学实验室的新学生,如果有任何问题,请随时纠正我。 我已经使用R中的vegan软件包通过以下脚本进行了CCA: cca.analysis <- cca(mod ~ genus1 + genus2 + genus3, data) 我目前正在尝试测量每个变量(类)的 ...
我的老师给我们做了以下练习: 目前,我所做的唯一过程是使用cv2.cornerHarris()获取两个图像的“ Harris Corners”,并将这些图像彼此相邻放置。 现在,我不知道如何获取角点本身及其周围的区域以生成可用于模板匹配的模板。 我希望,如果我掌握了这个技巧, ...
在执行CA之后,我想在数据集的列上执行HCPC。 由于某种原因,我还必须在开始时指定所有列的类型均为“ factor”,然后再将它们遍历并将其转换为数值。 我不知道为什么会这样,因为如果我检查每一列的类型(未将它们指定为因子),它们似乎都是数字...但是,当我不加载并转换数据时,却得到了错误 ...
我有一个数据集,其中包含在几个不同地点测得的存在物种数据 。 数据是在10年的跨度内测得的。 在许多站点上,一年内进行了几次测量。 测量频率不是恒定的,也不是所有位置都测量了几次,有些甚至只测量了一次。 我知道经典的去趋势对应分析在这里没有帮助,因为它没有考虑辅助因子时间 。 是否 ...
我想探索一个分类变量随着时间的推移相对于一组给定的其他分类变量的两种模式的概况。 我在下面粘贴了此类数据集的可重现示例。 为了探索这种模式的行为,我决定使用多重对应分析( FactoMineR包)。 为了考虑随时间的变化,一种可能性是将数据集分成 5 个子样本,代表 V5 的不同级别,然后在每个 ...
我使用了函数CA:CA(data [,2:5]) 我得到了那个图形: 我有一个包含五列的列联表:一个定性数据和四个定量数据。 但是,我不想使用数字来获得第一列的标签。 如果我输入CA(data[ ,1:5])我知道第一列是定性的而不是定量的,并且存在编译错误,那么您知道如何显示第 ...
如何在 Python 中运行简单对应分析 (CA)? 在 sklearn 库中,似乎只有多重对应分析 (MCA) 和规范对应分析 (CCA) 选项。 但是,我的数据不是分类数据,不需要 CCA 应用的额外线性约束。 基于CCA 上的这个链接<\/a>和MCA<\/a>上的这个 ...
我在R中使用这个factoextra包进行通讯分析。 当我打印出结果图时,找不到隐藏x和y零线的选项。 我知道主题设置基于ggplot2。有人可以帮助我找出如何隐藏这两行吗? 请在下面找到代码。 其他参考链接请参见此处: ggplot2主题 任何建议都可以! 非常感谢 ...
我想在数据上使用mjca(“ ca”包),以便更实际地估算尺寸的解释差异。 问题是我想提取活动变量和辅助变量的坐标,以便在数据框中进行编辑。 但是,mjca的输出中未提供变量的名称和尺寸。 在MCA(软件包“ FactoMineR”)中,输出如下所示: 有没有一种方法可以将变量名称 ...
我对R很陌生,我正在尝试对汇总数据进行Corresp分析(MASS程序包)。 尽管输出显示行和列得分,但生成的双图将列得分显示为零,从而使该图不可读(所有值按预期方式由行得分排列,但沿列得分平缓)。 该代码是 在此先感谢您对我做错了什么以及如何进行修改提出任何建议,谢谢! 马丁 ...
我有两个散点图,基于不同但相关的数据,它们是使用ggplot2的qplot()创建的。 (学习ggplot并不是当务之急,因为qplot已经足以满足我的需求)。 我想做的是叠加/叠加两个图表,以便每个图表的x,y数据都绘制在相同的绘图空间中。 复杂的是,我希望每个图都保留其格式/美学。 ...