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x * w 中的 dudi.hillsmith 错误:二元运算符的非数字参数 - dudi.hillsmith error in x * w : non-numeric argument to binary operator

我正在重新运行大约 6 个月前编写的 RLQ 和第 4 个角分析。 但是,分析 Q 表时出现错误。 我一直在关注 Stephane Dray 的 (2013) 教程并使用环境表的 dudi.pca(R,6 个站点的 6 个“数字”变量), 用于物种存在表的 dudi.coa(L,6 个站点的 15 ...

使用adjustText避免label重叠与Python王子对应关系分析 - Using adjustText to avoid label overlap with Python prince correspondence analysis

我已经阅读了 package adjustText在避免 label 重叠方面的效率,我想使用以下由prince创建的图表: 这是创建图像的代码: 在我能找到的所有adjustText示例中,总是可以直接访问标签的坐标。 在这种情况下如何访问标签的坐标? 如何将adjust_text应用于此图? ...

如何修复:“CA(dt, graph = FALSE) 中的错误:以下变量不是定量 Var1” - How to fix: “Error in CA(dt, graph = FALSE) : The following variables are not quantitative Var1”

我正在尝试在 R 中使用对应分析。 似乎 FactoMineR 中 function "CA" 的第一个参数必须是列联表。 “dt”是一个列联表,但它返回变量不是定量的。 X1的一个level是空的,不知道是不是Correspondence Analysis的问题 output 是: ...

FactoExtra仅提取前5个维度 - FactoExtra is only extracting the first 5 dimensions

我试图使用get_mca_ind()函数从FactoExtra解压到在每个维度个人捐款MCA (从FactoMiner包),这样我可以在进一步的分析中使用它。 无需获取所有维度的信息,而是可以确定前5个维度,因此我可以确定需要多少维度(使用scree plot或其他阈值)。 #this sh ...

是否有R函数使用FactoMineR(或任何其他软件包)绘制对应分析的第3维? - Is there an R function for plotting the 3rd dimension of a correspondence analysis using FactoMineR (or any other package)?

我正在对从考古现场报告中提取的分类频率数据进行对应分析。 我之所以选择CA,是因为据我所知,它可以处理存在/不存在的情况,这通常是考古数据的本质。 我使用FactoMineR和factoextra包创建了第一维和第二维的漂亮双目图。 但是,查看特征值百分比,我真的很想将第三个维度与前两个维 ...

如何在素食主义者中重新缩放变量并测量从CCA坐标到质心的距离? - How do you rescale variables and measure distance from CCA coordinate to centroid in vegan?

我是生物信息学实验室的新学生,如果有任何问题,请随时纠正我。 我已经使用R中的vegan软件包通过以下脚本进行了CCA: cca.analysis <- cca(mod ~ genus1 + genus2 + genus3, data) 我目前正在尝试测量每个变量(类)的 ...

使用Harris Corner Detection对2张图像进行Python OpenCV搜索对应 - Python OpenCV search correspondences of 2 images with Harris Corner Detection

我的老师给我们做了以下练习: 目前,我所做的唯一过程是使用cv2.cornerHarris()获取两个图像的“ Harris Corners”,并将这些图像彼此相邻放置。 现在,我不知道如何获取角点本身及其周围的区域以生成可用于模板匹配的模板。 我希望,如果我掌握了这个技巧, ...

在(M)CA之后对列(即变量)而非行(即个人)执行HCPC - Performing HCPC on the columns (i.e. variables) instead of the rows (i.e. individuals) after (M)CA

在执行CA之后,我想在数据集的列上执行HCPC。 由于某种原因,我还必须在开始时指定所有列的类型均为“ factor”,然后再将它们遍历并将其转换为数值。 我不知道为什么会这样,因为如果我检查每一列的类型(未将它们指定为因子),它们似乎都是数字...但是,当我不加载并转换数据时,却得到了错误 ...

随着时间的推移,去趋势对应分析是否可能? - Is a Detrended Correspondance Analysis over time possible?

我有一个数据集,其中包含在几个不同地点测得的存在物种数据 。 数据是在10年的跨度内测得的。 在许多站点上,一年内进行了几次测量。 测量频率不是恒定的,也不是所有位置都测量了几次,有些甚至只测量了一次。 我知道经典的去趋势对应分析在这里没有帮助,因为它没有考虑辅助因子时间 。 是否 ...

纵向数据多重对应分析 - Multiple Correspondence Analysis on longitudinal data

我想探索一个分类变量随着时间的推移相对于一组给定的其他分类变量的两种模式的概况。 我在下面粘贴了此类数据集的可重现示例。 为了探索这种模式的行为,我决定使用多重对应分析( FactoMineR包)。 为了考虑随时间的变化,一种可能性是将数据集分成 5 个子样本,代表 V5 的不同级别,然后在每个 ...

R中对应分析中的错误 - Error in Correspondence Analysis in R

我使用了函数CA:CA(data [,2:5]) 我得到了那个图形: 我有一个包含五列的列联表:一个定性数据和四个定量数据。 但是,我不想使用数字来获得第一列的标签。 如果我输入CA(data[ ,1:5])我知道第一列是定性的而不是定量的,并且存在编译错误,那么您知道如何显示第 ...

删除或隐藏R ggplot2 / factoextra图上的Zeroline - Remove or hide Zeroline on R ggplot2/factoextra plots

我在R中使用这个factoextra包进行通讯分析。 当我打印出结果图时,找不到隐藏x和y零线的选项。 我知道主题设置基于ggplot2。有人可以帮助我找出如何隐藏这两行吗? 请在下面找到代码。 其他参考链接请参见此处: ggplot2主题 任何建议都可以! 非常感谢 ...

mjca中MCA变量坐标和补充变量坐标的等效项是什么? - What are the equivalents of MCA variables coordinates and supplementary variables coordinates in mjca?

我想在数据上使用mjca(“ ca”包),以便更实际地估算尺寸的解释差异。 问题是我想提取活动变量和辅助变量的坐标,以便在数据框中进行编辑。 但是,mjca的输出中未提供变量的名称和尺寸。 在MCA(软件包“ FactoMineR”)中,输出如下所示: 有没有一种方法可以将变量名称 ...

R中的Corresp双线图-列得分绘制为0 - Corresp biplot in R - column scores plotted as 0

我对R很陌生,我正在尝试对汇总数据进行Corresp分析(MASS程序包)。 尽管输出显示行和列得分,但生成的双图将列得分显示为零,从而使该图不可读(所有值按预期方式由行得分排列,但沿列得分平缓)。 该代码是 在此先感谢您对我做错了什么以及如何进行修改提出任何建议,谢谢! 马丁 ...

在ggplot2中覆盖两个格式不同的qplots - Overlay two differently formatted qplots in ggplot2

我有两个散点图,基于不同但相关的数据,它们是使用ggplot2的qplot()创建的。 (学习ggplot并不是当务之急,因为qplot已经足以满足我的需求)。 我想做的是叠加/叠加两个图表,以便每个图表的x,y数据都绘制在相同的绘图空间中。 复杂的是,我希望每个图都保留其格式/美学。 ...


 
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