我想根据多个标准(Column1、Column2、Column3)以 R 中的树状图的形式创建一个包含多个项目(Name1、Name2、Name3、...)的分类图(我喜欢树状图的正交美学为此)。 我有以下 CSV (data.csv),其中包含每个标准中的项目及其分类: 以及以下 R 代码: ...
我想根据多个标准(Column1、Column2、Column3)以 R 中的树状图的形式创建一个包含多个项目(Name1、Name2、Name3、...)的分类图(我喜欢树状图的正交美学为此)。 我有以下 CSV (data.csv),其中包含每个标准中的项目及其分类: 以及以下 R 代码: ...
我想要一个带有右侧变量名称的水平树状图来显示相关系数。 如果我能在一些与 ggplot2 相关的包中实现它会很好,因为我希望图表看起来与我的其他图形相似。 scale_x_discrete(position="top)不起作用,因为标签消失了。这些是我到目前为止的结果: (我从: htt ...
我正在处理生态数据(沉积岩芯中不同深度处不同硅藻物种的丰度百分比),并希望将结果与代表分层聚类分析 (CONISS) 结果的树状图一起 plot,我将使用该树状图来拆分核心进入生态区。 这是我试图实现的事情类型的一个例子: 我已经成功地运行了聚类分析,但我正在努力以我想要的方式 plot 树状图。 ...
我在右对齐 R ggplot2 中多个绘图的水平 y 轴标题时遇到问题。 我有一个主要的 plot,它是一个带有使用 ggdendro package 创建的叶子标签的树状图,并且我在主要的 Z32FA6E1B78A9D4028953E60564A2AAC4 下方有多个彩条。 如果我使用 grid. ...
最小示例和 package 文档( https://rlbarter.github.io/superheat/ ): 我想实现两件事: 根据集群颜色分支(我必须确定 k 个集群)或在“选择的”集群顶部添加矩形。 我也很想提取相同的树状图并将其应用于不同的数据集(具有相同的变量)。 我相信树状图是 ...
我有一个使用ggpballoonplot的简单气球图: 我想知道是否可以添加树状图并基于此组织气球 plot? 我知道您可以使用corrplot做类似的事情,如下所示: Dendrogram with Corrplot (R)但正在努力将其应用于ggballoonplot function? ...
我有一棵系统树: 然后我将其转换为ggdend对象: 我想使用ggplot2绘制my.dend并添加到叶子饼图中。 这是描述每个叶子的饼图的data.frame : 我认为的绘图结合my.dend与labels.df使用scatterpie的geom_scatter ...
目标:我想在为同一数据集创建的2个树状图中保留标签颜色和图例颜色。 我有相同的数据集(40个观测值),可通过2个过程(预过滤和过滤)将其转换为树状图。 但是,标签颜色根据其聚类方式而改变(因此,树状图中的标签顺序也会改变)。 这是一个代码片段: d1_dendogram d ...
我有树状图的这段代码。 如何减小树状图(或y轴)的大小? 我使用此代码作为示例。 在我的数据集中,我有大标签,所以我没有足够的空间来包含它。 因此,我想减少用于y轴的空间,减小0到150之间的距离。而且,当我将图形保存为tiff时,图形的大部分是树状图,我看不清标签。 ...
目标:创建一个树状图,其分支由因子变量着色,结果图包含图例,以将分支颜色转换为每个因子变量值。 我有一些包含因子变量的数据,后跟我正在创建树状图的数字数据: 数据尺寸为:161 x 60,739。 利用这些数据,我获得了带有彩色分支但没有图例的树状图,以及带有彩色标签(而非分支) ...
我正在尝试使用ggdendrogram绘制具有大量节点的dendrogram ,并且它相当慢(例如,与dendextend相比): 有什么方法可以使其加速,使其与dendextend的绘图速度可比吗? 另外,是否指定rotate=T或 我得到了树状图指向左: 但我希 ...
这个想法是将R包ClustOfVar和ggdendro组合在一起,以直观地总结变量聚类。 当数据中的列较少时,除了没有覆盖的区域(如下图中的圆圈所示)之外,结果非常好。 以mtcars为例: 当列数很多时,会发生另一个问题。 即,色块部分的高度与树状图的高度不匹配。 ...
我想使用 ggplot2 创建一个漂亮的树状图。 这是我正在做的事情的可重复示例: 这是结果 我想扩展矩形,使其覆盖 x 轴。 如果我改变,例如, 到 然后我得到这个 这就是我想要获得的(这个结果是用 Photoshop 改变的) 任何帮助都非常受欢迎。 事先非常感谢。 ...
我正在尝试使用包 dendexend 创建一个树状图。 它创建了非常好的 gg 树状图,但不幸的是,当你把它变成一个“圆圈”时,标签跟不上。 我将在下面提供一个示例。 我的距离对象在这里: http : //speedy.sh/JRVBS/mydist.RDS 这基本上给了我这个形象: 这很 ...
当我使用伟大的包ggdendro绘制我的树时,我遇到了一个问题:有一天,它突然产生的树的所有标签都消失了。 当我在本地计算机和服务器中运行以下代码时,会得到不同的结果。 服务器版本中不存在本地计算机和标签中的标签。 服务器版本(确定): 本地Windows 7版本(无标签 ...
我用这种方式使用ggdendro创建一个树状图: 我得到: 我的网络是: 我希望垂直轴上有网络节点的名称,并且簇线与使用cluster_edge_betweenness函数计算的社区的颜色相同。 它们是否丰富多彩并不重要: 节点(标签)或 簇或线 ...
我正在使用此链接按照类别绘制带有彩色标签的漂亮的树状图。 第二个答案是我在此链接中看到的( R中的水平树状图的树状切割和矩形周围簇的矩形 ),它使用以下代码: 我想剪掉一些群集,因为我有16个群集,带有145个标签,所以我只能查看几个群集,因为我只想聚焦/剪切/放大其中的几个群集。有什 ...
这是我的数据: 我加上团体因素 以下代码 产生这个情节: 当我添加 更改标题,更改图例键的大小,但忽略形状参数: 这是为什么? 谢谢! ...
我试图将R中的层次聚类结果绘制为树状图,矩形识别聚类。 下面的代码用于垂直树形图,但对于水平树形图( horiz=TRUE ),不绘制矩形。 有没有办法对水平树形图做同样的事情。 此外,我想绘制一条线来切割所需距离值的树。 如何在R中绘制它cutree函数返回簇,但是也可以 ...
我正在使用 R 使用 Ward 的平方欧几里德距离进行层次聚类分析。 我有一个 x 列(站)和 y 行(浮点数)的矩阵,第一行包含标题(站名)。 我想要一个很好的树状图,其中车站的名称出现在树的底部,因为我无法解释我的结果。 我的目标是找到那些相似的电台。 但是,使用以下代码,我得到了较低分支的编号 ...