尝试通过 Power BI 访问 PubChem 但是我遇到了以下问题: This application requires Javascript. Please turn on Javascript in order to use this application. 只是想知道是否有人知道为什么会 ...
尝试通过 Power BI 访问 PubChem 但是我遇到了以下问题: This application requires Javascript. Please turn on Javascript in order to use this application. 只是想知道是否有人知道为什么会 ...
您能否告诉我是否可以在 PubChemPy 中获取元素的名称? 我在可以按名称找到 PubChem CID 的文档中找到: 但我需要反过来,通过 CID 来查找元素的名称。 也许有人知道该怎么做? ...
我目前正在尝试编写一个程序,该程序采用化合物的标识符(称为 CID 编号),然后使用 pubchempy 文档返回化合物的属性。 但是,当我尝试将从 pubchempy 获得的数据值合并到初始数据库时,我不断收到错误消息。 这是我现在写的代码: 但是,我收到一条错误消息,上面写着,ValueErr ...
为了尽可能简洁地总结,我有一个数据文件,其中包含化合物列表及其 ID 号(“CID”号)。 我的目标是使用 pubchempy 的 pubchempy.get_properties 函数和 pandas 的 df.map 函数,以使用“CID”编号作为标识符,从本质上获取每个化合物的属性(每行一个化 ...
本质上,我正在读取一个包含一堆化合物的 csv 文件,并且我正在尝试将 pubchempy.get_properties 函数应用于包含每种化合物的 CID(标识符)编号的 CID 列。 但是,我无法让它工作。 奇怪的是我没有收到任何错误(我最初确实得到了一些错误,并且有点修改它以尝试修复它们), ...
当我 go 到代码中的 web 地址时,我没有从“同义词”部分获得内容。 它进行选择,但将其作为列表而不是 output 文本内容。 ...
我正在使用以下代码在 pubchem 网站上进行搜索。 我需要从搜索结果的屏幕中获取“复合 CID:”编号,但我无法获取。 我需要这方面的帮助。 ...
我一直在尝试使用 PubChemPy 在 python 上找出这个错误,但我被卡住了。 我正在尝试输入化学品列表并生成 Canonical Smiles 信息以获取大约 200 种化学品的列表。 这是我正在使用的代码 任何帮助,将不胜感激 ...
我认为 pubchem 这里有我需要的东西,我想要一个数据库,它是 - 或可以转换成 - 化学标识符表:学校项目的一系列属性。 问题是,pubchem 太大,他们提供的唯一我知道如何解码的文件是 XML(他们还提供 SDF 和 ASN,链接如下: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.go ...
我的任务是仅使用查询字符串(例如 h2o)和 JS 从网站(pubchem)下载 json 文件。 我知道可以进行解析,但是代码太多了,因为我需要解析很多页面才能获得目的地。 有没有其他选择可以解决这个问题? 使用谷歌没有给我任何想法): ...
我一直在使用 PubChem API 将化学微笑转换为结构,但仍然有错误。 这是我的 google colab 我尝试使用 PIL 图像加上 TKinter https://colab.research.google.com/drive/1TE9WxXwaWKSLQzKRQoNlWFqztVSo ...
我想解析这个 JSON 文件。 用第二列作为 Canonical SMILES 和第三列作为 Isomeric SMILES 得到类似的东西。 有人可以告诉我如何在 jq 中以最好的方式做到这一点吗? ...
我现在想从化学数据库中使用R检索一些数据,主要是name , CAS Number和molecular weight 。 不过,我有麻烦rvest提取我正在寻找的信息。 这是我到目前为止的代码: 但是,当我尝试创建name_html ,R仅返回字符(空)。 我正在使用Selecto ...
R代码的以下几行产生斜体错误。 除非我做的很蠢,否则这似乎是一个rpubchem错误: 输出: 有人知道这是怎么回事吗? ...
我想使用JSON(或XML)导出工具来解析R中Pubchem中给定化合物的所有化学性质。 示例:ALPHA-IONONE,pubchem化合物ID 5282108 https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/5282108 要么 ...
与其爬取 PubChem 的网站,我更喜欢从 PubChem ftp 站点本地生成图像: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pubchem/specifications/ 唯一的问题是我仅限于 OSX 和 Linux,我似乎无法找到一种以编程方式生成他们网站上的二维图像的方法。 看 ...
许多化学家面临的一个烦人的问题是将化学药品的CAS登记号(存储在一些不易获得的商业数据库中)转换为Pubchem标识符(公开可用)。 Pubchem支持在两者之间进行转换,但只能通过其手动Web界面进行转换,而不能通过其官方的PUG REST编程界面进行转换。 在此基于e-utiliti ...
我目前正在做一个项目,我必须从代谢物数据库PubChem中请求数据。 我正在使用Apache的HttpClient。 我正在执行以下操作: 问题在于此代码将流化整个XML文件: 等等 我想要的是,例如,我可以请求PubChem ID,它将粘贴与该ID相对应的值。 ...
我想下载pubchem物质数据库并将所有信息放入MySQL数据库。 这是可能的,如果是这样的话怎么样? 是否有自动更新数据库的脚本? ...
我想从 Pubchem 数据库中提到的所有 IUPAC 名称中构建一些长度的前缀和后缀列表,以便我可以在我的项目中进一步将它们用作功能。所以我想要所有 IUPAC 化学名称在一个文本文件中或我可以提取这些列表的某种格式。 ...