标签[r-package] - 堆栈内存溢出

R 更新后在新位置重新安装 R 软件包 - Reinstalling R Packages in New Location after R Update

我是 R 的新手，但我已经使用了一点。然而，我遇到了一个问题并且无法弄清楚，尽管已经阅读了十几个其他资源。由于我不会深入的原因，我不得不更新 R 和 R Studio。但是，现在我的软件包都不会安装。例如，当我尝试安装dplyr时，这就是我得到的：从我在其他类似问题上看到的情况来看，我需要 ...

从新的 package 命名空间中的 Rcpp function 加载 R 包的 function - Loading a R package's function from Rcpp function in a new package namespace

我正在为 R 开发 package，并希望在 Rcpp function 中加载 R package 的功能。我知道 Rcpp::Environment env("package:package_of_interest")，但这仅在通过库（"package_of_interest"）从 R 加载 ...

安装R package时，致命错误：R.h：没有那个文件或目录，如何找到R.h？ - when installing a R package, fatal error: R.h: No such file or directory, How to locate R.h?

从 github 安装 R package 时我收到错误消息：我知道我的 R.h 在哪里，我尝试更改进入但是有太多的文件和这样的错误看来我应该告诉 g++ 在哪里可以找到 D:/R-4.2.2/include，有人可以指导我是否应该这样做或者我应该做什么。我正在使用：R 版本 4.2.2 ...

R package：如果首选失败，则全局导入等效的 package - R package: global import of equivalent package if preferred one fails

这个问题的灵感来自 tidytable 作为整个 tidyverse 包和我自己的情况的有意替代品的特定性质。我在工作中开发了几个 R 包，它们广泛依赖于 tidytable。 R 环境非常有限且集中控制（并且无法更改）并且包自动回退到 dplyr + tidyr + purrr 将是有利的。 ...

R Roxygen2 警告：在文档 object 中使用但不在代码中的变量 - R Roxygen2 Warning: Variables with usage in documentation object but not in code

我正在尝试制作一个包含数据文件的 R package。一个数据文件 mydata.Rd 用以下 Roxygen2 代码注释：我收到错误： Variables with usage in documentation object 'mydata' but not in code: 'mydata' ...

从 package 使用 function 但同时使用不同的版本 - Use function from a package but different versions simultaneously

我有同一个 package foo的多个版本（都有一个 function bar ），我都想在同一个脚本中使用。按照这个问题，我可以使用library("foo", lib.loc = "pkgs/v1") v1 v1。但这会加载 package 的所有功能。现在我想将 v1 版本的foo:: ...

二元运算符的 roxygen2 文档 - 包括示例导致警告或检查错误 - roxygen2 documentation of binary operators - including examples causes warning or error on check

我尝试在我的 R 包中包含二元运算符，当然想正确记录它们。在学习 Roxygen 如何处理中缀二元运算符（例如 %in%）之后？我尝试了公认的解决方案变体，但我有一个问题。如果我以 1:1 的方式复制它并想将其应用于我自己的 package，并应用 @GSee 的方法，那么只要我不引入 @ex ...

如何在 R package 测试中使用 memdb_frame() - How to use memdb_frame() in an R package test

我已将 function 添加到 package，它对 dbplyr 数据库连接执行简单操作。在交互式测试中，我使用memdb_frame创建一个虚拟数据库，如下所示：然后 function 在x上执行它的工作。但是当我尝试在包的testthat测试中以相同的方式创建数据库时，出现错误：我 ...

如何在 R 上安装 install_github 函数？ - How to install install_github function on R?

我正在尝试使用一个有效示例中的 github 包。我使用了建议的方法在这里让安装-github工作我收到一条警告，将我重定向到R website安装页面，然后出现错误Error in parse_repo_spec(repo): Invalid git repo specification: ...

如何将私有依赖项添加到 R 开发包的 DESCRIPTION 文件？ - how do I add private dependency to DESCRIPTION file for R dev package?

我在 R 中构建了一个新包（我们称之为myNewPackage ），它使用存储在我公司的 bitbucket 存储库中的私有包（我们称之为privatePackage ）。根据我在 Google 上找到的一些回复（包括这个），我明白我需要添加Remotes:到我的包 DESCRIPTION 文件 ...

使用 ggplot2 生成图表的 pdf 生成问题 - Issue with pdf generation of graph made with ggplot2

下图是我使用 ggplot2 生成的图形的 pdf 输出。它卡在加载中，无法查看。下面的代码是我正在处理的用于生成图形的包中的一个函数。由于“数据”的数据类型是一个列表，我在将其分配给“L”时将其转换为双精度型。我使用了一个带有“数据”的小数据集，首先包含以下值。基因列表低频计数 AT1 ...

无法从 GitHub 上的 R package 安装 vi.nette - Cannot install vignette from an R package on GitHub

我编码了一个 R package 托管在我的 GitHub 上。我包含了一个 vi.nette，我可以安装 package 并加载 vi.nette，而不会从 R 和 RStudio 执行以下操作：但是，我有一些无法安装 vi.nette 的同事（他们可以下载 package 的唯一方法是执行d ...

我正在创建我的第一个 R package 但似乎无法将 function 到 output 文件放入 rstudio 环境 - I am creating my first R package but cant seem to get a function to output a file into the rstudio enviroment

我正在创建我的第一个 R package。其中一个功能是接收 vcf 文件并将其格式化为 R env 以供进一步使用。这是下面的代码！在此处输入图像描述安装 package 之后，我得到的是：当我尝试在测试 vcf 文件上执行 function 时没有错误，但在环境中没有做任何事情我尝试了 d ...

R：库错误（affy）：错误：package 或 dyn.load（文件，DLLpath = DLLpath，...）中“affy”的命名空间加载失败：无法加载共享对象 - R: Error in library(affy): Error: package or namespace load failed for ‘affy’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): unable to load shared objec

Mac M2 R 4.2.2 我做了什么调整： 1\我打开/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library 删除文件夹'affy'，然后重新安装。但是错误仍然出现在这里。顺便问一下，'Bio conductor', 'limma', and ...

安装 LiDAR 森林数据地面点云处理 package 确实有效 - Install LiDAR Terrestrial Point Cloud Processing of Forest Data package does work

我尝试安装 TreeLS package，但我收到此消息。我发现 package 不再出现在 CRAN 中，我尝试从源代码安装，使用：但是，package 中的某些功能不起作用。如果有人能帮助我，我将不胜感激。我的博士期末论文取决于它。谢谢！ ...

我如何在 R package 文档的示例部分中引用 model object - How do I reference a model object in the example section of documentation in an R package

我正在创建一个 R package。在我的 package 项目文件夹中，我有一个 model object 保存为.rds文件。在一个名为data的文件夹中。此外，我在R文件夹中保存了一个 function。如何在R文件夹中的 function 文档的示例部分中引用 model objec ...

如何记录和导出使用 Rcpp function 制作的常量？ - How to document and export a constant made with a Rcpp function?

我有一个没有参数的Rcpp function lazyNA 。我想在我的 package 中使用它的值，所以我需要导出它并且我也想使用roxygen2记录它。我试过了：#' @name NA_lazy_ #' @title The missing lazy value. makeActiveB ...

我可以将哪个 R package 用于每年 plot kernel 密度地块？ - Which R package can I use to plot kernel density plots per year?

我测量了每年论文摘要和标题中感叹号的出现次数。现在，我想使用 kernel 密度估计来显示每个年份的这个数字的分布。我想 plot 我在另一份出版物中找到的数据 (Plavén-Sigray et al. eLife 2017, https://elifesciences.org/articl ...

R 中的运行时与开发时依赖关系 - Run-time vs develop-time dependencies in R

我正在 R 中开发一个 package ( golem )，它在Import ( DESCRIPTION ) 中返回一个关于多余 package 的NOTE ：检查 package 依赖项……注意导入包括 34 个非默认包。从如此多的包中导入使得 package 容易受到其中任何一个变得不可用的 ...

当我开发 R package 时，如何让自己摆脱 .Rd 文件 - How I can ease out myself of .Rd file when I am developing an R package

我正在使用 R studio 1.2.1335 开发自己的 R package。 Within R folder of my package, I have function r2.R for which I did not build r2.rd file in man folder. 当我使用 ...