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使用邻接矩阵生成网络 - Generate network using adjacency matrix

我在生成 .network object 时遇到问题,以便在 R 中进行进一步的 ergm 估计。也就是说,当我为 .network function 提供邻接矩阵时,它会生成一个错误,即 my.network 包含循环和多条边,这根本不是真的。 大约两年前,我用相同的矩阵运行了相同的代码,一切正常 ...

使用节点属性模拟 ERGM - Simulate ERGM with nodal attributes

我想知道是否有可能模拟来自 ERGM 分布的网络,其中节点具有属性。 例如,如果我想模拟 a.network ,其中具有相似属性的节点之间的三角形更有可能出现,我会做类似的事情: 但问题是,这些依赖于节点属性(例如nodematch )的统计信息需要参数,我没有这些参数,因为 .network 事 ...

如何解决ergm退化? - how to resolve the ergm degeneracy?

这是一个需要您帮助的问题。 我使用 ergm 来 model 的形成。网络。但它总是退化。只有 174 个节点(顶点),304 度。 我使用代码如下 问题是从参数-----gwesp(0.2,fixed=T)和gwdegree(2,fixed=T)),速度很慢,报错如下:Estimating eq ...

2021-07-13 03:47:41   1   485    statnet  
当我在图中使用简化时绘制图形的问题 - Problem of plotting graph when I use simplify, in graph

我想 plot 我的图表。 我提供了一个样本数据集。 我用simplemented来去除循环,但它完全影响了数据的结构。 当我 plot 数据不使用简化时,我有正确的顶点和边缘着色但有循环。 我使用简化来删除循环和它之后的颜色,这是错误的,因为它的每个节点和边缘都应该具有与我在代码中定义的颜色相同的 ...

为什么在指数随机图模型 (ergm) 中引入“blockdiag”约束参数会大大减慢计算速度? - Why introducing a 'blockdiag' constraints argument in exponential random graph models (ergm) drastically slow down the computation?

我正在尝试在加权网络(network_ex)上运行一个有价值的指数随机图 model(ergm)。 该网络显示了四个不同组中的个人之间的交互。 组之间不能发生交互,因此需要在 model 中包含块对角约束。 然而,当我包含这个块对角约束时,计算会在蒙特卡洛最大似然估计的特定迭代上卡住至少 24 小 ...

2021-03-31 15:26:39   1   60    r / statnet  
使用动态网络可视化更改节点颜色 - Changing node color with dynamic network visualisation

我正在尝试创建一个网络 animation 来显示节点如何随时间变化 state。 用例是 Covid-19 的接触者追踪。 我使用了基于代理的 model 来模拟 Covid-19 的传播。 从这里我提取了我的联系网络。 我正在努力弄清楚 tsna package 如何在每个时间片上更改节点颜色( ...

发出具有块对角约束的运行值指数随机图 model (ergm) - issue running valued exponential random graph model (ergm) with block diagonal constraint

我正在尝试在加权网络(network_ex)上运行指数随机图 model(ergm)。 该网络显示了四个不同组中的个人之间的交互。 组之间不能发生交互,因此需要在 model 中包含块对角约束。 但是,当我包含块对角线约束时,ergm function(否则运行)会返回错误(见下文),而我的 R ...

如何计算 ERGM 预测概率的标准误? - How to calculate the standard errors of ERGM predicted probabilities?

我无法根据 ERGM model 的预测概率估计标准误差来计算置信区间。 获得预测概率不是问题,但我想了解预测周围的不确定性。 下面是一个基于文艺复兴时期佛罗伦萨家庭婚姻和商业关系数据集的可复制示例。 根据 model,估计财富差 10 对应于平局的概率为 0.182511。 我的第一个问题是,这 ...

ndtv 中的动态顶点属性 - Dynamic vertex attribute in ndtv

我一直在尝试在 ndtv 中实现动态顶点属性,实际上我设法创建了不同大小的顶点,但经过仔细检查,它们与我认为我指定的值不对应。 相反,顶点大小与第一个 ID 具有最大大小的顶点 ID 成正比。 我试图通过为每个周期创建一个顶点拼写来控制大小,并为大小参数设置不同的值 导致以下结果,其中 vs 是顶点 ...

在 R 中使用两个边缘属性建模 ERGM - Modeling ERGM with two edge attributes in R

我有一个场景,其中一个边缘属性影响另一个边缘属性。 有没有办法在 ERGM 中实现 model? 例如,考虑合同复杂性影响合同价值的外包合同。 我想 model 以一种我可以使用复杂性预测具有合同价值的网络的方式评估 ERGM。 我知道我们可以在 ERGM 建模中使用节点属性,是否可以 model ...

从数据框中的二进制和字符变量创建 two-mode.network - Creating two-mode network from binary and character variables in data frame

SNA 人员:我正在尝试从 R 中的数据框创建一个 two-mode.network。我有一个组织列表,这些组织通过父组织中的共同成员资格连接。 我在那个用二进制变量编码的组织中有成员资格。 我已经通过以下代码(来自Create adjacency matrix based on binary ...

具有三维边缘列表的网络? - Network with three-dimensional edgelist?

我有数据提供有关参与者 c 的信息流,按源自源 s 的输入细分到合作伙伴 p。 网络数据通常只有一种信息:数据/信息流从 A->B、B->C 等。 但是,我的数据显示哪些从 A->B 流向 C,哪些从 A->B 流向 D。 数据结构为三列边缘列表。 我有点不明白如何 ...

在ggnet中使用颜色 - Using color in ggnet

我有一个我这样制作的网络: 我使用此代码将其转换为网络对象 我相信我的代码应该从我的边缘列表创建一个网络并创建一个名为 value 的联系属性 我想可视化这个矩阵,并在数字大时将节点颜色设置为深蓝色,数字小时将节点颜色设置为浅蓝色 我试过这个代码 我只得到三个节点和三个领带,一切都是黑色 ...

如何在二分投影中将模式转换为属性 - How to convert mode into an attribute in bipartite projection

我有一个关于在转换为单模式投影后保留节点信息的快速问题。 我想使用公司与公司的关系作为我的新边缘列表,但保留交易编号作为边缘属性,以便我理想地拥有一个如下所示的新数据集: 源目标交易 AB 14 CD 15 fg 17 哈 18 其中“来源”、“目标”和“交易”都在各自的列中。 (对不 ...


 
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