RStudio的knitr编译问题（Windows）

Question

我有一个基于knitr的Rnw文件，可以在Mac（v0.97.316）和knitr（v1.1）上的RStudio中将其编译为pdf很好，但是在Windows环境（相同版本）中却遇到编译错误。 我已经在两种环境中检查了RStudio中的选项，它们是一致的。

Windows安装程序似乎总是向“ .tex”文件中注入“ \\ SweaveOpts {concordance = TRUE}”，即使我在Rnw文件中没有这样的标志，并且/或者如果我在首选项中切换了设置，和/或如果我将“ opts_knit $ set（concordance = FALSE）”选项添加到针织设置块中。 如果我从“ .tex”文件中删除该行，并在cmd提示符下手动对其进行编译，则将按预期生成输出。

我不确定这是RStudio还是knitr问题，但是任何指针都将不胜感激。

请注意，我还将这个问题发布在RStudio支持板上（ http://support.rstudio.org/help/discussions/problems/5039-knitr-compile-problems-with-rstudio-windows?unresolve=true ）。

Answer 1

它注入\\SweaveOpts{concordance=TRUE}原因很可能是您的织布工，是Sweave而不是knitr ，并且还启用了Rnw一致性： http ://www.rstudio.com/ide/docs/authoring/rnw_weave但是我不能肯定地说这不是Windows版本的RStudio的错误。 无论如何，很容易验证是否是RStudio问题-打开“ Compile PDF面板，您应该看到如下日志：

如果您的编织者是编织者，那么您将看到类似以下内容：

这是我的配置（我在Ubuntu下）：

如果确实使用了knitr ，并且RStudio仍然插入\\SweaveOpts{concordance=TRUE} ，那么我猜它一定是RStudio的错误。

Answer 2

我在“ R CMD build KFAS-master”下载为2016年4月24日以“ KFAS-master.zip”的形式单击此问题，并单击了从GitHub（ https://github.com/helske/KFAS ）上的KFAS下载“ ZIP”。 我无法复制该问题，但是我所使用的解决方法是找到弹出窗口中提到的行（在下面复制），并在其前面加上“ %%”以将其注释掉。

下载后，我将其解压缩并将文件夹名称更改为“ KFAS”。 然后，我得到一个命令提示符，并导航到包含重命名为KFAS的KFAS-master文件夹的目录。 这次“ R CMD建立KFAS”按预期工作。 然后我在RStudio 0.99.893（截至2016-04-26的当前版本）中打开〜KFAS / vignettes / KFAS.Rmw。 我更改了一些内容并保存了结果。 当我重复“ R CMD build KFAS”时，我得到了下图所示的问题。

Jouni Helske将我引导至该职位。 我通过将“ %%”添加到“ \\ SweaveOpts {concordance = TRUE}”之前，注释掉了下面屏幕截图中提到的第69行。 我保存了结果，“ R CMD建立KFAS”成功了。

似乎偶尔会在* .Rnw文件中插入“ \\ SweaveOpts {concordance = TRUE}”这样的行，但我不知道它是什么。 我在装有OS X 10.11.2的MacBook Pro上运行R 3.2.4。

感谢Yihui和其他人在此主题中的早期文章。

该屏幕快照显示弹出窗口抱怨：“似乎您在第69行...中使用的是Sweave特定的语法。”

Answer 3

即使在默认情况下为“使用...编织Rnw文件”设置了knitr时，我也遇到了同样的问题。

我通过转到工具/全局选项/ Sweave并将“使用Weave Rnw文件使用”设置为Sweave并按Ok 。 然后，我返回并将其设置为knitr ，现在一切正常。

我想这确实是Rstudio错误