R / igraph：在深度优先搜索回调中对获取/设置顶点属性的任何调用都会导致段错误

Question

我发现在回调中使用igraph库对get / set vertex属性的任何调用都会导致R中出现段错误。例如，一段代码中的琐碎回调：

  dfsCallBack <- function(graph, data, extra) {
    cat("in:", paste(collapse=", ", data), "\n")
    distFromRoot <- data[2]
    vertexID <- data[1]
    set.vertex.attribute(graph, 0, name = 'color', value = 'blue')
    FALSE    
  }
  graph.dfs(g, 1, in.callback = dfsCallBack)

产生此错误：

  graph.dfs(g, 1, in.callback = dfsCallBack)
in: 0, 0 

 *** caught segfault ***
address 0x0, cause 'memory not mapped'

Traceback:
 1: .Call("R_igraph_dfs", graph, root, neimode, unreachable, as.logical(order),     as.logical(order.out), as.logical(father), as.logical(dist),     in.callback, out.callback, extra, rho, PACKAGE = "igraph")
 2: graph.dfs(g, 1, in.callback = dfsCallBack)

Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace
Selection: 

怎么了 另外，igraph在处理这些错误时可能应该更健壮，因为R之类的崩溃对于R之类的高级语言而言并不理想。

Answer 1

有两点。

1. 如果您说set.vertex.attribute(graph, ...) ，则实际上不会更改graph ，但是会返回具有更新属性的新副本。 R对象（几乎总是）是不可变的，您不能更改它们，只能基于它们创建新对象。

2. set.vertex.attribute(graph, 0, name = 'color', value = 'blue')是错误的，因为顶点ID从1开始，所以0无效。 这应该报告为错误，并且已经在我们的开发树中修复。

3. 这不是错误，而是错误。 igraph错误不会使R崩溃，它们只会给出错误消息。 由于igraph代码和R在同一线程中运行，igraph错误可能会使R崩溃，并且除了避免错误外，我们对此无能为力。

我建议使用igraph.dfs的结果来igraph.dfs地设置属性。 当然，您可以使用回调来记录信息或终止DFS。