ggplot2：在同一图中绘制各种密度

Question

我还有一个关于ggplot2的问题...但是这次我什至不确定我想做什么...让我们从一个简单的例子开始； 这是我到目前为止所拥有的：

library(reshape2)
library(ggplot2)

a.df <- data.frame(
  id=c('a','b','c','d','e','f','g','h','i','j','k','l','m','n','o','p','q','r','s','t','u','v','w','x','y'),
  var1=c(25,35,46,19,35,68,78,23,65,78,98,32,65,74,24,56,78,12,34,76,87,12,54,87,34), 
  group1=c(1,2,'NONE','NONE',1,2,2,1,3,4,3,'NONE','NONE',4,4,3,1,1,2,3,4,'NONE','NONE',2,3), 
  group2=c(1,'NONE',1,1,2,2,'NONE',2,'NONE',2,3,4,3,4,1,'NONE',1,3,4,'NONE',4,4,3,'NONE',2)
)

ggplot(data=subset(a.df,group1!='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density() +
  facet_grid(. ~ group1)
ggplot(data=subset(a.df,group1=='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density()

ggplot(data=subset(a.df,group2!='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density() +
  facet_grid(. ~ group2)
ggplot(data=subset(a.df,group2=='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density()

所以我想在这里做以下事情：

1-首先，仅将切面分割为2x2，而不是4x1（我尝试使用ncol = 2，但没有用）

2-绘制第二个图（子集（a.df，group1 =='NONE'））以及第一个图的4个面。 对第三和第四做同样的事情。

3-如果可能的话，最好将两个结果绘图（4个方面的1st + 2nd，以及4个方面的3rd + 4th）合而为一，但是我在这里看到的问题是，这些方面取决于2个分组变量...可能吗？

所以总的来说，我觉得输入的data.frame需要一些重塑，但是我不知道该怎么做。非常感谢！

Answer 1

在此发布本文之后，向每个构面添加一条密度曲线非常简单。 我想这就是您想要做的，但是我可能是错的。 请注意， facet_wrap允许您选择列数，而不是facet_grid 。

ggplot(data=subset(a.df,group1!='NONE'), aes(x=var1)) + 
    geom_density() +
    facet_wrap( ~ group1, ncol = 2) +
    geom_density(data=subset(a.df,group1=='NONE', var1), aes(var1, color = "NONE")) +
    scale_color_manual(name = "Baseline", values = "blue")

在将数据集融为长格式之后，对两个组执行相同的操作似乎很简单，但是它仅适用于facet_grid ，因此无法控制列数。

require(reshape2)
dat2 = melt(a.df, measure.vars = c("group1", "group2"), variable.name = "group")

ggplot(data=subset(dat2, value != "NONE"), aes(x=var1)) +
    geom_density() + facet_grid(group ~ value) +
    geom_density(data=subset(dat2,value=='NONE', c(var1, group)), aes(var1), color = "blue")

我不得不使用更多的“蛮力”方法来使它与facet_wrap一起使用。 本质上，我必须创建一种虚拟数据集，其NONE类别中的var1的值在每个组的1-4级中重复。 请参阅datnone的输出以获得更好的解释。 希望其他人有更好的方法可以解决此问题，因为这可能会完成工作，但肯定不是很漂亮。

datnone = cbind(dat2[dat2$value == "NONE", 2:3], 
             value = rep(1:4, each = nrow(dat2[dat2$value == "NONE",])) )

ggplot(data=subset(dat2, value != "NONE"), aes(x=var1)) +
    geom_density() + facet_wrap(group ~ value, ncol = 2) +
    geom_density(data = datnone, aes(var1), color = "blue")

编辑以添加带有两行两种颜色的图例

这是添加图例并控制linetype和color一种方法。 您也可以控制图例的名称和标签，以使其更加美观。

ggplot(data=subset(a.df,group1!='NONE'), aes(x=var1, color = "GROUP", linetype = "GROUP")) + 
    geom_density() +
    facet_wrap( ~ group1, ncol = 2) +
    geom_density(data=subset(a.df,group1=='NONE', var1), 
               aes(var1, color = "NONE", linetype = "NONE")) +
    scale_linetype_manual(values = c("solid", "dotted") ) +
    scale_color_manual(values = c("black", "red") )

Answer 2

这是一种避免刻面的方法，只是将每个单独的图保存在列表中，然后调用grid.arrange获得所需的结果。

拥有同一个情节的多个副本并不会轻易导致facet_grid 。 另外， facet_grid并不是真正为2x2图设计的，因为其中只有一个构面变量。

### no. levels of factor group1 not equal to 'NONE' = 4
sum(!levels(a.df$group1)=="NONE")
### define list to store results
list1 <- vector("list", 8)
### subset to remove "none"
df1 <- a.df[!a.df$group1=="NONE", ]
for (i in 1:4){
### subset per level
    df2 <- df1[df1$group1==unique(df1$group1)[i], ]
### plot and title
    g1 <- ggplot(df2, aes(x=var1)) + 
        geom_density() +
            ggtitle(unique(df1$group1)[i])
        list1[[2*i-1]] <- g1
}
### plots of NONE
df1 <- a.df[a.df$group1=="NONE", ] 
g2 <- ggplot(df1, aes(x=var1)) +
    geom_density() +
    ggtitle("NONE")
list1[[2]] <- list1[[4]] <- list1[[6]] <- list1[[8]] <- g2
### 
library(gridExtra)
do.call(grid.arrange, c(list1, list(nrow=2, ncol=4)))

给

您应该能够对此进行调整，并对其他感兴趣的地块执行相同的操作。