在NetworkX中绘制图形

Question

我正在尝试在NetworkX中绘制任何图形，但什么都没有，甚至没有错误：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
g1=nx.petersen_graph()
nx.draw(g1)

Answer 1

添加到最后：

plt.show()

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import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
g1 = nx.petersen_graph()
nx.draw(g1)
plt.show()

从已调用plt.ion()的交互式shell运行时， plt.ion() plt.show() 。 这可能是很多例子中省略的原因。

如果您从一个脚本（如果这些命令plt.ion()没有被调用），该plt.show()是必要的。 plt.ion()适用于交互式会话，但不建议用于脚本 。

Answer 2

在ipython笔记本中，只需输入魔法

%matplotlib inline

要么

%matplotlib notebook

Answer 3

您可以使用jupyter notebook轻松地使用networkx图进行绘图。 见第一个例子。

或者，您可以使用Bokeh绘制图表，这会添加有用的功能。 包装holoviews使绘制带有散景的图形变得更加简单。 它在鼠标悬停在节点上时添加了自动突出显示和标签显示等功能。 但是，编辑颜色等似乎是一个问题。

%pylab inline  
# `pylab notebook`  # for interactive plots

import pandas as pd
import networkx as nx
import holoviews as hv

G=nx.Graph()
ndxs = [1,2,3,4]
G.add_nodes_from(ndxs)
G.add_weighted_edges_from( [(1,2,0), (1,3,1) , (1,4,-1) , (2,4,1) , (2,3,-1), (3,4,10) ] ) 
nx.draw(G, nx.spring_layout(G, random_state=100))

这里有散景和全息视图的例子：

hv.extension('bokeh')
%opts Graph [width=400 height=400]
padding = dict(x=(-1.1, 1.1), y=(-1.1, 1.1))
hv.Graph.from_networkx(G, nx.layout.spring_layout).redim.range(**padding)

您应该尝试一下并将其绘制在笔记本中以查看差异。

Answer 4

它添加以下工作正常：

import matplotlib.pyplot as plt
plt.show()

你的代码。 我工作得很好。