使用 sed 或 VIM 用新行替换空格

Question

我有以下数据。

1455931_at Chrna3 1420468_at Asb17 1445520_at −−− 1436717_x_at Hbb−y 1431788_at Fabp12 1458975_at −−−

使用sed或 VIM 编辑器如何将其更改为

1455931_at Chrna3 
1420468_at Asb17 
1445520_at −−− 
1436717_x_at Hbb−y 
1431788_at Fabp12 
1458975_at −−−

所以所有带有_at的单词将是每一行的第一个。 每行由成对的 _at 和基因项组成。

Answer 1

在 Vim 中，我会这样做：

:%s/ /^M/g
:g/_at/j

其中^M是通过按 control-V（Windows 上的 control-Q）然后按 Enter/Return 键来输入的。

这假设令牌之间有单个空格； 正如@Floris 建议的那样，您可以使用s/ \\+/^M/g将多个连续空格转换为单个换行符。 或者您可以使用s/\\v\\s+/^M/g对任何连续的空格（包括制表符和文字空格字符）执行相同的操作。

Answer 2

惊人但真实：

sed 's/\([^ ]*\) \(.[^ ]* \)/\1 \2\
> /g' <<<"1455931_at Chrna3 1420468_at Asb17 1445520_at −−− 1436717_x_at Hbb−y 1431788_at Fabp12 1458975_at −−−"
1455931_at Chrna3 
1420468_at Asb17 
1445520_at −−− 
1436717_x_at Hbb−y 
1431788_at Fabp12 
1458975_at −−−

换句话说，我使用的sed字符串中有一个物理回车（ >是由控制台添加的）：

sed 's/\([^ ]*\) \(.[^ ]* \)/\1 \2\
> /g'

您可以尝试使用其他表达式（现在我假设是平衡对，但如果您特别想匹配第一个字符串末尾的at ，则可以）。

Answer 3

使用 sed: s/ /\\n/g; s/_at\\n/_at /g s/ /\\n/g; s/_at\\n/_at /g可能有一个更优雅的解决方案，但这个解决方案可以。

Answer 4

对于你的例子，

sed -e 's/\(_at [0-9a-zA-Z−]*\) /\1\n/g'

Answer 5

sed 's/\(_at[[:blank:]]\{1,\}[^[:blank:]\{1,\}\)\([[:blank:]]\)/\1\
\2/g' YourFile

这允许任何“空格”作为分隔符，并且在一次或多次出现时，最后一行没有 \\n。 这在以_at终止的字符串的任何部分之后需要 1 个“单词”，而不是单词的交替（从我这边解释）。

这并不能避免将 2 个“_at”写在 2 个单独的行上（如果缺少/空字）

Answer 6

这是一个awk解决方案：

awk '{for (i=1;i<=NF;i+=2) print $i,$(i+1)}' file
1455931_at Chrna3
1420468_at Asb17
1445520_at ...
1436717_x_at Hbb.y
1431788_at Fabp12
1458975_at ...

这将打印两个和两个字段。

另一个版本：

awk '{printf $0 FS;getline;print}' RS=" " file

Answer 7

您可以使用它来查找第一个单词以“_at”结尾的所有 2 词对

grep -oP '\S+_at\s+\S+' file

或者，在每第二个单词后放置一个换行符：

tr -s '[:blank:]' '\n' < file | paste -d " " - -