使用列名和行名在R中用列值填充矩阵

Question

我有一个非常大的数据集，所以我想避免循环。

我有三列数据：

col1 =时间表示为10000、10001、10002、10100、10101、10102、10200、10201、10202、10300，...（共18000次）

col2 = ID编号1 2 3 4 ...（总共500个ID）

col3 =在特定时间与特定ID相关联的读数。 0.1 0.5 0.6 0.7 ...说这叫做Data3

10000 1 0.1

10001 1 0.5

10002 1 0.6

10100 1 0.7

10200 1 0.6（注意-缺少一些随机条目）

我想将其表示为矩阵（称为DataMatrix），但是缺少数据，因此简单的重塑将不起作用。 我想要缺少的数据作为NA条目。

DataMatrix当前是一个500列和18000行的NA矩阵，其中行名和列名分别是时间和ID。

1 2 3 4 ....

10000 NA NA NA NA ....

10001不适用不适用不适用....

有没有办法让R遍历Data3的每一行，通过将Data3 [，3]读入名称与Data3 [，1]和Data3 [有关的矩阵的行和列中来完成DataMatrix ，2]。 但是没有循环。

感谢所有聪明的人。

Answer 1

这是一个可能的id值为1:10，时间值为1:20的解决方案。 首先，创建数据：

mx <- matrix(c(sample(1:20, 5), sample(1:10, 5), sample(1:50, 5)), ncol=3, dimnames=list(NULL, c("time", "id", "reading")))
times <- 1:20
ids <- 1:10
mx
#      time id reading
# [1,]    4  3      25
# [2,]    5  4       9
# [3,]    9  7      45
# [4,]   18  1      40
# [5,]   11  8      28

现在，使用outer将时间/ id的所有可能组合传递给查找函数，该函数返回相应的reading值：

outer(times, ids, 
  function(x, y) {
    mapply(function(x.sub, y.sub) {
      val <- mx[mx[, 1] == x.sub & mx[, 2] == y.sub, 3]
      if(length(val) == 0L) NA_integer_ else val
    },
    x, y)
} )

这将产生（希望）所需的答案：

#      [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
#  [1,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [2,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [3,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [4,] NA   NA   25   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [5,] NA   NA   NA   9    NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [6,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [7,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [8,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
#  [9,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   45   NA   NA   NA   
# [10,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [11,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   28   NA   NA   
# [12,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [13,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [14,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [15,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [16,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [17,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [18,] 40   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [19,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   
# [20,] NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA   NA  

Answer 2

如果我正确理解您的意见：

Data3 <- data.frame(col1=10000:10499,  
                    col2=1:500,
                    col3=round(runif(500),1))

library(reshape2) 
DataMatrix <- dcast(Data3, col1~col2, value.var="col3")
DataMatrix[1:5, 1:5]
#    col1   1   2   3   4
# 1 10000 0.4  NA  NA  NA
# 2 10001  NA 0.6  NA  NA
# 3 10002  NA  NA 0.9  NA
# 4 10003  NA  NA  NA 0.5
# 5 10004  NA  NA  NA  NA