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在R中的字符向量中查找唯一对

[英]Finding unique pairs in a character vector in R

我有一个很长的字母列表,我想知道有多少对字母? 例如,如果我有AABBAAACC则会有5对。

我不知道该怎么做。

x <- "AABBAAACC"

我是R的初学者,所以请善待!

1)gregexpr试试这个:

> length(gregexpr("(.)(?=\\1)", "AABBAAACC", perl = TRUE)[[1]])
[1] 5

2)rollapply

> library(zoo)
> > sum(rollapply(strsplit("AABBAAACC", "")[[1]], 2, function(x) x[1] == x[2]))
[1] 5

2a)或稍微紧凑:

> library(zoo)
> library(gsubfn)
> sum(fn$rollapply(strsplit("AABBAAACC", "")[[1]], 2, ~ x[1] == x[2]))
[1] 5

3)头/尾

> s <- strsplit("AABBAAACC", "")[[1]]
> sum(tail(s, -1) == head(s, -1))
[1] 5

增加了更多解决方案。

@G。 格洛腾迪克的答案更好,但我想到了一种非正则表达方法:

runs <- rle(unlist(strsplit("AABBAAACC", NULL)))
sum(runs[[1]][runs[[1]] > 1] - 1)

找到一个字符的最长运行长度。 减去一个以获得对的数量。 继续添加这些。

暂无
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