使用slurm sbatch为集群作业分配参数

Question

我正在使用slurm sbatch来parralel在集群上启动matlab功能。

为了将数字参数分配给matlab函数，我的sbatch文件中的正确语法是什么？

我尝试过以下（和sike一样）：

#!/bin/bash

#SBATCH --partition=debug
#SBATCH --time=0-00:15:00
#SBATCH --cpus-per-task=12
#SBATCH -n1

VAR1=50
VAR2=40

BASE_MFILE_NAME=RUNAGT
MATLAB_MFILE=.m

  srun --exclusive --cpus-per-task=12 matlab2013b/bin/matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay -r "RUNAGT(${SLURM_ARRAY_TASK_ID},VAR1,VAR2);exit" -logfile testV${SLURM_ARRAY_TASK_ID}.log &
wait

$ {SLURM_ARRAY_TASK_ID}正在运行，但matlab无法识别VAR1和VAR2。

错误：未定义的函数或变量'VAR1'。

Answer 1

我相信它不会读取你的变量，因为你没有在它们前面放一个$ 。 你的线条应该是：

srun --exclusive --cpus-per-task=12 matlab2013b/bin/matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay -r "RUNAGT(${SLURM_ARRAY_TASK_ID},${VAR1},${VAR2});exit" -logfile testV${SLURM_ARRAY_TASK_ID}.log &