[英]How can I merge / Sum Rows that have the same Value in a given column. Then Histogram. R studio
[英]R histogram. How can I label some but not all individual data points
我的数据框包含三个变量:
Row_Number Sample_ID Expression_Level
1 hum_449 0.25
2 hum_459 0.35
4 mur_223 0.45
我想使用生成第三列的直方图
hist(dataframe$Expression_Level)
我想用列表标记一些条形,这些列表对应于特定表达水平的Sample_ID值列表。
我将所需的Sample_IDs存储为列表对象,还存储为具有相应Row_Number和Expression_Level值的数据框(基本上只是原始数据框的一个子集)。 我不知道下一步该怎么做,甚至不知道该在搜索引擎中键入什么内容。
我安装了ggplot2,因为朋友告诉我这可能会有所帮助,但是我不熟悉它,并且面临着同样的问题,即在阅读文档时不知道要查找什么。 如果可能,不希望安装更多软件包。
您可以使用以下代码将与Sample_ID的第三个元素相对应的标签添加到直方图的第三个“条”上。 但是,这实际上似乎是一种奇怪的方法,因为直方图的条形图是计数。 您可能想使用barplot吗? 相同的代码将使用“ barplot”代替hist。
temp <-hist(dataframe $ Expression_Level)mtext(text = Expression_Level [3],side = 1,line = 2,at = temp [3])
像这样吗
set.seed(1) # for reproduceale example
# crate sample data - you have this already
df <- data.frame(sample_ID=paste0("S-",1:100),
Expression_Level=round(runif(100),1),
stringsAsFactors=F)
# you start here...
labels <- aggregate(sample_ID~Expression_Level,df,c)
labels$lab <- sapply(labels$sample_ID,function(x)paste(unlist(x),collapse="|"))
library(ggplot2)
ggplot(df, aes(x=factor(Expression_Level))) +
geom_histogram(fill="lightgreen",color="grey50")+
geom_text(data=labels,aes(y=.1,label=lab),hjust=0)+
labs(x="Expression_Level")+
coord_flip()
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