使用R中的边属性从邻接表创建igraph对象

Question

我有一个4列的邻接矩阵。 前两列是我要成为igraph对象中的顶点的源节点和目标节点。 我可以使用下面的代码来实现。

al <- data.frame(sourceNode=c('a', 'a', 'b', 'c'), 
             consumerNode=c('b', 'c', 'c', 'a'), 
             edgeAtt1=c('highway', 'road', 'road', 'path'),
             edgeAtt2=c('1999', '2010', '2014', '1999'))

require('igraph')
g <- graph.edgelist(as.matrix(al[,c('sourceNode', 'consumerNode')]))

但是，当我创建此igraph对象时，我想做的是将al 3列和第4列作为边缘属性。

一些函数functionThatINeed让我可以执行以下操作：

g <- functionThatINeed(al[,c('sourceNode', 'consumerNode')]), edgeAttributes=al[,c('edgeAtt1', 'edgeAtt2')])

Answer 1

创建图形时无法执行此操作，但是可以在使用edge.attributes()之后立即执行。

require('igraph')
g <- graph.edgelist(as.matrix(al[,c('sourceNode', 'consumerNode')]))
edge.attributes(g) <- al[,c('edgeAtt1', 'edgeAtt2')]

如果您真的想要，可以创建自己的函数

graph.edgelist.attributes <- function(et, at=NULL, directed=F) {
    g <- graph.edgelist(el, directed)
    edge.attributes(g) <- at
    g
}

Answer 2

我想我确实找到了答案。 igraph包中的graph.data.frame允许您从一个提供边缘属性的边缘列表数据框和另一个提供节点属性的data.frame创建一个igraph对象。

http://www.inside-r.org/packages/cran/igraph/docs/graph.data.frame