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Bioperl程序执行中的错误

[英]Error in Bioperl program execution

原文 2014-06-03 05:37:35 7 1 algorithm/ perl/ bioinformatics/ bioperl/ clustal

我已经安装了bioperl，但对从哪里获取以及在哪里运行bioperl程序感到困惑。然后我对其进行了测试，并成功运行了多个序列的程序。 对准。

产生错误

无法在@INC中找到Bio / Tools / Run / Alignment / Clustalw.pm（@INC包含：/ etc / perl /usr/local/lib/perl/5.14.2 /usr/local/share/perl/5.14。 2 / usr / lib / perl5 / usr / share / perl5 /usr/lib/perl/5.14 /usr/share/perl/5.14 / usr / local / lib / site_perl。）在msa.pl第3行。BEGIN失败-编译在msa.pl第3行中止。

1 个解决方案

这意味着缺少Bio :: Tools :: Run :: Alignment :: Clustalw模块。 您需要安装它。 使用cpan Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw进行安装。

另请参阅：在perl中自动安装perl依赖项

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