在Cygwin中永久设置Anaconda的Python路径

Question

我正在尝试在我的Windows 7机器上安装Anaconda。 我经常使用cygwin来完成我的命令行工作，我想从那里管理Anaconda。 我已经通过图形安装程序没有任何问题，并检查了必要的框以重置我的python安装的默认路径。 我继续检查python的位置，最初我得到了这个......

$ which python
/usr/bin/python

从这里python工作得很好......

$ python
Python 2.7.5 (default, Oct  2 2013, 22:34:09)
[GCC 4.8.1] on cygwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.

但我正试图从蟒蛇工作，所以我只需要重新定义我的道路......

$ export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH
$ which python
/cygdrive/c/anaconda/python

现在我应该好好去，但是当我尝试进入python时，它只是挂起

$ python

知道为什么会这样吗？ 详细回报，下面......

$ python -v
# installing zipimport hook
import zipimport # builtin
# installed zipimport hook
# C:\anaconda\lib\site.pyc matches C:\anaconda\lib\site.py
import site # precompiled from C:\anaconda\lib\site.pyc
# C:\anaconda\lib\os.pyc matches C:\anaconda\lib\os.py
import os # precompiled from C:\anaconda\lib\os.pyc
import errno # builtin
import nt # builtin
# C:\anaconda\lib\ntpath.pyc matches C:\anaconda\lib\ntpath.py
import ntpath # precompiled from C:\anaconda\lib\ntpath.pyc
# C:\anaconda\lib\stat.pyc matches C:\anaconda\lib\stat.py
import stat # precompiled from C:\anaconda\lib\stat.pyc
# C:\anaconda\lib\genericpath.pyc matches C:\anaconda\lib\genericpath.py
import genericpath # precompiled from C:\anaconda\lib\genericpath.pyc
# C:\anaconda\lib\warnings.pyc matches C:\anaconda\lib\warnings.py
import warnings # precompiled from C:\anaconda\lib\warnings.pyc
# C:\anaconda\lib\linecache.pyc matches C:\anaconda\lib\linecache.py
import linecache # precompiled from C:\anaconda\lib\linecache.pyc
# C:\anaconda\lib\types.pyc matches C:\anaconda\lib\types.py
import types # precompiled from C:\anaconda\lib\types.pyc
# C:\anaconda\lib\UserDict.pyc matches C:\anaconda\lib\UserDict.py
import UserDict # precompiled from C:\anaconda\lib\UserDict.pyc
# C:\anaconda\lib\_abcoll.pyc matches C:\anaconda\lib\_abcoll.py
import _abcoll # precompiled from C:\anaconda\lib\_abcoll.pyc
# C:\anaconda\lib\abc.pyc matches C:\anaconda\lib\abc.py
import abc # precompiled from C:\anaconda\lib\abc.pyc
# C:\anaconda\lib\_weakrefset.pyc matches C:\anaconda\lib\_weakrefset.py
import _weakrefset # precompiled from C:\anaconda\lib\_weakrefset.pyc
import _weakref # builtin
# C:\anaconda\lib\copy_reg.pyc matches C:\anaconda\lib\copy_reg.py
import copy_reg # precompiled from C:\anaconda\lib\copy_reg.pyc
# C:\anaconda\lib\traceback.pyc matches C:\anaconda\lib\traceback.py
import traceback # precompiled from C:\anaconda\lib\traceback.pyc
# C:\anaconda\lib\sysconfig.pyc matches C:\anaconda\lib\sysconfig.py
import sysconfig # precompiled from C:\anaconda\lib\sysconfig.pyc
# C:\anaconda\lib\re.pyc matches C:\anaconda\lib\re.py
import re # precompiled from C:\anaconda\lib\re.pyc
# C:\anaconda\lib\sre_compile.pyc matches C:\anaconda\lib\sre_compile.py
import sre_compile # precompiled from C:\anaconda\lib\sre_compile.pyc
import _sre # builtin
# C:\anaconda\lib\sre_parse.pyc matches C:\anaconda\lib\sre_parse.py
import sre_parse # precompiled from C:\anaconda\lib\sre_parse.pyc
# C:\anaconda\lib\sre_constants.pyc matches C:\anaconda\lib\sre_constants.py
import sre_constants # precompiled from C:\anaconda\lib\sre_constants.pyc
# C:\anaconda\lib\locale.pyc matches C:\anaconda\lib\locale.py
import locale # precompiled from C:\anaconda\lib\locale.pyc
import encodings # directory C:\anaconda\lib\encodings
# C:\anaconda\lib\encodings\__init__.pyc matches C:\anaconda\lib\encodings\__init__.py
import encodings # precompiled from C:\anaconda\lib\encodings\__init__.pyc
# C:\anaconda\lib\codecs.pyc matches C:\anaconda\lib\codecs.py
import codecs # precompiled from C:\anaconda\lib\codecs.pyc
import _codecs # builtin
# C:\anaconda\lib\encodings\aliases.pyc matches C:\anaconda\lib\encodings\aliases.py
import encodings.aliases # precompiled from C:\anaconda\lib\encodings\aliases.pyc
import operator # builtin
# C:\anaconda\lib\functools.pyc matches C:\anaconda\lib\functools.py
import functools # precompiled from C:\anaconda\lib\functools.pyc
import _functools # builtin
import _locale # builtin
# C:\anaconda\lib\encodings\cp1252.pyc matches C:\anaconda\lib\encodings\cp1252.py
import encodings.cp1252 # precompiled from C:\anaconda\lib\encodings\cp1252.pyc
# zipimport: found 13 names in C:\anaconda\lib\site-packages\runipy-0.1.0-py2.7.egg
# zipimport: found 144 names in C:\anaconda\lib\site-packages\setuptools-3.6-py2.7.egg
Python 2.7.7 |Anaconda 2.0.1 (64-bit)| (default, Jun 11 2014, 10:40:02) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Anaconda is brought to you by Continuum Analytics.
Please check out: http://continuum.io/thanks and htt

我遇到的另一个（可能是相关的）问题是每次关闭/打开cygwin时都需要重置路径。 我已将以下文本输入.bashrc和.profile以尝试永久设置路径：

# Set path to python from anaconda install
export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH

打开和关闭cygwin后，我回到：

$ which python
/usr/bin/python

这可能与设置某些系统环境变量有关吗？

Answer 1

要在Cygwin中使用交互式Python shell，我使用-i选项。

为了从Anaconda安装中获取它，我使用了上面建议的步骤：

$ export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH
$ which python
/cygdrive/c/anaconda/python

然后我用-i选项在Cygwin中启动python：

$ python -i
Python 2.7.8 |Anaconda 2.1.0 (64-bit)| (default, Jul  2 2014, 15:12:11) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Anaconda is brought to you by Continuum Analytics.
Please check out: http://continuum.io/thanks and https://binstar.org
>>>>

图书馆也运作良好。 例如，现在可以导入pandas库（通过Anaconda安装）。

>>>> import pandas
>>>> pandas.DataFrame
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>

现在为了使这个永久化我在我的bashrc文件中添加了路径：

$ echo 'export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH' >> .bashrc
$ source .bashrc
$ which python
/cygdrive/c/anaconda/python

我希望这有帮助。

Answer 2

路径

关于您的路径问题，请参阅安装anaconda以与Windows一起使用以了解如何解决该问题。 或者，你可以运行/cygdrive/c/Anaconda/python.exe来启动Anaconda / windows python并让标准的python指向cygwin版本。

请注意，互联网上提供的建议中很少也包括对PYTHONPATH的必要更改：如果您使用anaconda / windows python，您还需要anaconda python库。 像numpy这样的二进制模块肯定会崩溃或行为异常，如果你混淆了。 检查这个的最简单方法是在cygwin中安装一个模块，在Conda中不需要它并测试是否可以从anaconda python导入它。 如果可以，你的道路是错的。

Anaconda python会自动将c:\\Anconda添加到你的PYTHONPATH中，但是如果你将它设置为服务CYGWIN python库，那么它们将在Anaconda libs之前找到。 尝试

import sys
sys.path

终奌站

然而，这也是一个终端问题：Anaconda（Windows）python期望一个Windows shell和一个现代的cygwin shell就像一个xterm ，所以非常不同。 通过运行python --help诊断这个，如果它工作但普通的python挂起，交互式提示就是问题。 这意味着你可以运行python程序，你只是无法与它们进行交互。

解决这个问题的方法是使用cygwin bash shell而不是cygwin terminal （两者都在开始菜单中的Cygwin组下）。 它们看起来非常相似，但是bash shell中的字体不太漂亮，你不能使窗口宽于80个字符（就像所有其他CMD窗口一样，永远不会理解'功能'）。 这是在CMD窗口内运行的cygwin bash，你的anaconda python将是交互式的。 cygwin terminal为你提供了一个运行在putty衍生物中的bash shell，它模仿xterm并且不能被anaconda python使用。

Answer 3

我也遇到了使用我的Cygwin / Windows 7系统设置anaconda的问题。 有用的是以下内容：

1. 编辑了〜/ .bashrc。 将以下内容添加到文件底部。

   export PATH=/cygdrive/c/Anaconda:$PATH

2. 这将Cygwin的python映射到anaconda发行版，作为在Cygwin控制台中输入which python证明。 但是，当启动python时，它会挂断，迫使我从命令中删除^ C. 我发现python -i将启动交互式python解释器而没有任何问题。

Answer 4

conda对cygwin的解释还有另一个问题。 当您为环境获取激活脚本时，它会预先例如

/C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah
/C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Library/mingw-w64/bin/C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Library在/ usr / bin中
/C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Library/bin
/C/Users/Thomas.Harris/AppData/Local/Continuum/Anaconda3/envs/blah/Scripts

到你的路径。 但是，这些不是cygwin中的正确目录。

我修好了

ln -s /cygdrive/c /C

然后，如果你创建具有特定版本的python的conda环境，他们应该工作。

Answer 5

关于永久设置路径， 编辑主目录中的.profile （它是一个隐藏文件）。

.profile（其他名称也有效，请参阅bash手册页）包含bash命令。 当bash作为登录shell启动时执行。

在此文件的底部，输入您的set path命令：

export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH

至于为什么python挂起，请提供更多信息 - 例如python -v的输出是什么？

Answer 6

我来这里有点晚了，但我和@thomasshouler有同样的问题。 尝试将下面的导出行添加到.bash_profile和.profile文件的末尾以及.bashrc文件（如上所述）。 确保为每个文件“source .bash_profile”等。

export PATH=/cygdrive/c/anaconda:$PATH

Answer 7

发现对于Anaconda 4，做：

vim /home/[Username]/.bash_profile

附加到最后一行：

PATH=$PATH:/cygdrive/c/Users/[Username]/Anaconda3/Scripts/

这个解决方案对我有用，因为无法找到通常的anaconda3 / bin。

Answer 8

一旦如上所述更新了Cygwin路径，您还可以在.bashrc文件中添加别名：

alias python='python -i'

这将从Cygwin bash提示符以交互模式调出Anaconda python解释器