未返回功能中的列表/字典

Question

我正在尝试使用BioPython在Python中编写脚本，该脚本读取FASTA文件并生成原始DNA序列列表作为条目。

由于此代码将由我将要编写的许多其他脚本使用，因此我希望用于此目的的函数位于单独的Python文件中，该文件可以在我编写的其他所有脚本的开头导入。 包含我当前正在调用的函数的脚本是这样的：

from Bio import SeqIO
def read_fasta(dna):
    genome = []
    for seq_record in SeqIO.parse(dna, "fasta"):
        genome.append(str(seq_record.seq))
    return genome

当我从cmd在Python中调用此函数时，该函数可以正常工作并按需要读取生成列表的文件。 但是，如果尝试再次访问列表genome ，则会得到Traceback | NameError: name 'genome' not defined Traceback | NameError: name 'genome' not defined错误。

有人甚至可以说我已经提出了return genome声明，可以解释为什么会这样吗？ 我该如何解决这个问题？

Answer 1

genome在功能的局部范围内，因此从“外部”看不到。 您应该将read_fasta函数的结果分配给某个变量，以便访问该函数的返回结果。 例如：

new_variable = read_fasta("pcr_template.fasta")

而且它读取-让new_variable被分配给函数的结果read_fasta与"pcr_template.fasta"作为参数。

现在，只需访问new_variable即可访问genome （或函数返回的任何内容）。