合并来自 R 中多个目录的多个 .txt 文件

Question

合并来自不同子目录的 .txt 文件

我有一个文件夹，里面装满了过去日期的子文件夹（例如 01_14），每个日期文件夹内有 11 个名为 01.txt、02.txt 的文件...如何将所有 .txt 文件合并为一个数据框架，一列是它来自的文件夹的名称，一列是它来自的文件名？

我的层次结构看起来像这样：

\Data
     \01_14
           01.txt
           02.txt
           ...
           11.txt 
     \02_14
           01.txt
           02.txt
           ...
           11.txt 
     \03_14
           01.txt
           02.txt
           ...
           11.txt 

Answer 1

当我需要读取多个文件时，我使用read.stack辅助函数，它基本上是 read.table 的包装器，但它还允许您在每个文件的基础上添加额外的列。 这是我如何在您的场景中使用它的方法。

dir<-"Data"

subdir<-list.dirs(dir, recursive=F)

#get dir/file names
ff<-do.call(rbind, lapply(subdir, function(x) {
    ff<-list.files(x, "\\.txt$", include.dirs = FALSE, full.names = TRUE)
    data.frame(dir=basename(x), file=basename(ff), 
        fullpath=ff, stringsAsFactors=F)
}))

#read into data.frame
read.stack(ff$fullpath, extra=list(file=ff$file, dir=ff$dir))

Answer 2

尝试这个：

fileNames <- list.files("Data", recursive = TRUE, full.names = TRUE)
fileContents <- lapply(fileNames, function(fileName) 
  paste(readLines(fileName, warn = FALSE), collapse = "\n"))
meta <- regmatches(fileNames, regexec(".*Data/(.*)/(.*)$", fileNames))
merged <- mapply(c, fileContents, lapply(meta, "[", -1), SIMPLIFY = FALSE)
as.data.frame(t(do.call(cbind, merged)))