来自NumericVector的Rcpp R样本等效项

Question

我已经创建了一个NumericVector，我需要从中采样一个随机的Integer。 我尝试使用各种RcppArmarillo函数，但对我而言无效。 该功能如下：

//#include <algorithm>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
using namespace Rcpp;
using namespace arma;
using namespace std;

int simulateNextStepC(double currentAmount, double lastPaid, int currentStatus, int currentMaturity, NumericMatrix amountLinkMatrix, NumericMatrix statusMatrix, double  percentile4Capping=1, bool verbose=false)
{
int nrow = amountLinkMatrix.nrow(), outsize;

bool check;
LogicalVector positionsToSample(nrow); 

for(int i=0;i< nrow;i++) {
check=false;
check=((statusMatrix(i,currentMaturity)==currentStatus)&&(is_finite(statusMatrix(i,currentMaturity+1))));
positionsToSample[i]=check;
}

outsize=sum(positionsToSample);

IntegerVector historicalStatus(max(outsize,1));
int out;
if(outsize==0) 
out=currentStatus; 
else { 
   for(int i=0, j=0; i<nrow; i++) {
     if(positionsToSample[i]){
       historicalStatus[j]=statusMatrix(i,currentMaturity+1);
       j++;
     }
   }
   out=RcppArmadillo::sample(historicalStatus,1); // SAMPLING HERE
};

返回 }

Answer 1

您的函数存在一些问题，导致不同的错误。

1. 您需要在文件中添加// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]] ，通常将其放置在#include语句之后。 没有这个，您将得到一个编译错误- fatal error: RcppArmadilloExtensions/sample.h: No such file or directory
2. RcppArmadillo::sample(...)可能会或可能不会导致您出错。 在此Rcpp Gallery帖子中 ，作者大概使用RcppArmadillo::sample可能没有问题。 但是，我收到以下错误消息： error: reference to 'RcppArmadillo' is ambiguous out=RcppArmadillo::sample(historicalStatus,1); 。 我通过使用Rcpp::RcppArmadillo:sample来解决此问题； 考虑到using namespace Rcpp;进行声明，这对我来说似乎很奇怪using namespace Rcpp; 到位。
3. 与基本R函数sample ，我认为您不能仅使用两个参数来调用RcppArmadillo::sample这样做会导致此错误： error: no matching function for call to 'sample(Rcpp::IntegerVector&, int)' 。 通过为替换参数提供布尔值可以解决此问题： Rcpp::RcppArmadillo::sample(historicalStatus,1,false)
4. 进行上述更改之后，我得到以下错误： error: invalid user-defined conversion from 'Rcpp::Vector<13, Rcpp::PreserveStorage>' to 'int' 。 通过添加Rcpp::as轻松解决，即out=as<int>(Rcpp::RcppArmadillo::sample(historicalStatus,1,false));
5. 我不确定您是否打算将其作为独立函数导出到R环境中，但是如果是这样，则需要在函数上方// [[Rcpp::export]] 。

我注意到您中的三个参数尚未使用lastPaid ， percentile4Capping和verbose -我假设您还没有机会在函数体中实现它们。 我无法在实际数据上对此进行测试，因为您没有在问题中提供任何信息，但是在进行了上述更改之后，为我编译了此代码：

#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
using namespace arma;
using namespace std;
// [[Rcpp::export]]
int simulateNextStepC(double currentAmount, double lastPaid, 
                      int currentStatus, int currentMaturity, 
                      NumericMatrix amountLinkMatrix, 
                      NumericMatrix statusMatrix, 
                      double percentile4Capping=1, 
                      bool verbose=false)
{
  int nrow = amountLinkMatrix.nrow(), outsize;

  bool check;
  LogicalVector positionsToSample(nrow); 

  for(int i=0; i<nrow; i++) {
    check = false;
    check = ((statusMatrix(i,currentMaturity)==currentStatus) &&
             (is_finite(statusMatrix(i,currentMaturity+1))));
    positionsToSample[i] = check;
  }

  outsize = sum(positionsToSample);

  IntegerVector historicalStatus(max(outsize,1));
  int out;
  if( outsize==0 ) {
    out=currentStatus; 
  } else { 
    for(int i=0, j=0; i<nrow; i++) {
      if( positionsToSample[i] ) {
        historicalStatus[j]=statusMatrix(i,currentMaturity+1);
        j++;
      }
    }
    out=as<int>(Rcpp::RcppArmadillo::sample(historicalStatus,1,false));
  }
  return out;
}