根据它们的中心性着色顶点

Question

我试图改变igraph生成图中顶点的颜色。 更具体地说，我有一个从邻接矩阵创建的95节点图，我想根据它们的度/中间性/特征值中心性/亲密度对它们进行着色，但我猜想在我知道如何用一个，我将能够与其他人一起做。

所以我编写了图形生成的基础知识，直到现在：

数据集< - read.csv（“〜/ Google Drive / Cours M2 / Network Economics / Data / Collabs_2013.csv”，sep =“;”）
基质<-as.matrix（数据集）
ADJ <-graph.adjacency（基体）
剧情（形容词）
btw <-betweenness（adj，directed = FALSE）

我现在有一个95个中间值的向量，我想绘制一个颜色渐变的图形，该颜色跟随中介值（例如，从最低值的红色到绿色到最高值）。 我猜我必须弄乱顶点的属性，但我不知道如何输入矢量作为颜色属性。

Answer 1

好像你已经完成了大部分工作。 您只需要知道colorRamppalette并为网络设置vertex.color 。 假设你必须线性改变颜色，

做就是了

fine = 500 # this will adjust the resolving power.
pal = colorRampPalette(c('red','green'))

#this gives you the colors you want for every point
graphCol = pal(fine)[as.numeric(cut(btw,breaks = fine))]

# now you just need to plot it with those colors
plot(adj, vertex.color=graphCol)

归功于此 。 在回答这个问题之前，我正在使用一种效率更低的方法来分配颜色。

Answer 2

请注意：

定义可能会有问题

palette = colorRampPalette(c('blue','green'))

作为'调色板'功能，也被igraph使用，因此igraph后来产生错误。

请参阅R中igraph网络中顶点的颜色调色板问题