RStudio Shiny ERROR：没有名为“shinydashboard”的软件包

Question

我想在我的Ubuntu 14.10笔记本电脑上运行http://rstudio.github.io/shinydashboard/ 。

我按照安装说明进行操作：

http://rstudio.github.io/shinydashboard/get_started.html

基本的shiny页面工作。 例如：

HTTP：//本地主机：3838 /样品的应用程式/你好/

但是，当我尝试其中一个shinydashboard示例时，我收到错误：

HTTP：//本地主机：3838 /样品的应用程式/光泽/

ERROR: there is no package called "shinydashboard"

如果我在终端中运行R会话，我可以加载shinydashboard库，如果我在R会话中复制+粘贴此代码，我会得到一个带有仪表板的浏览器窗口：

library(shiny)
library(shinydashboard)

ui <- dashboardPage(
  dashboardHeader(),
  dashboardSidebar(),
  dashboardBody()
)

server <- function(input, output) { }

shinyApp(ui, server)

它说：

Attaching package: 'shinydashboard'

The following object is masked from 'package:graphics':

    box

> 
> ui <- dashboardPage(
+   dashboardHeader(),
+   dashboardSidebar(),
+   dashboardBody()
+ )
> 
> server <- function(input, output) { }
> 
> shinyApp(ui, server)

Listening on http://127.0.0.1:7093

我试图安装闪亮服务器的开发版本，但这也没有帮助。 这是我的sessionInfo() ：

> sessionInfo()
R version 3.1.1 (2014-07-10)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_GB.UTF-8        LC_COLLATE=en_GB.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_GB.UTF-8    LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] shinydashboard_0.2.3 shiny_0.11.1.9002   

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] bitops_1.0-6    devtools_1.7.0  digest_0.6.8    htmltools_0.2.6
 [5] httpuv_1.3.2    httr_0.6.1      mime_0.2        R6_2.0.1       
 [9] Rcpp_0.11.3     RCurl_1.95-4.5  stringr_0.6.2   tools_3.1.1    
[13] xtable_1.7-4   

编辑：

更多信息：

ls -ld /usr/local/lib/R/site-library
drwxrwsr-x 11 root staff 4096 Mar  1 12:47 /usr/local/lib/R/site-library

任何想法为什么我不在http：// localhost：3838上工作 ？ 哪个打包需要以root身份安装？

Answer 1

问题是，闪亮的服务器无法找到您安装的软件包，因为它将它们作为一个名为shiny的不同用户运行。 此用户是在安装shiny-server时创建的

解决此问题的最简单（也是最安全的恕我直言）方法是使用以下步骤将软件包安装为闪亮的用户。

1. 使用sudo passwd shiny为用户设置密码，现在输入并确认密码
2. 使用以下方法切换到闪亮的帐户： su - shiny
3. 调用R使用$ R （没有sudo）
4. 安装所需的软件包，在这种情况下： install.packages("shinydashboard")

请注意，如果您在同一台计算机上安装了rstudio-server，则可以使用该接口执行步骤2-4。 只需使用相同的域/ ip并使用：8787用于rstudio-server接口而不是：3838用于shiny-server。

Answer 2

在Ubuntu（和Debian）上你有几个选择。

1. 执行ls -ld /usr/local/lib/R/site-library并注意该目录由group adm拥有。 让自己成为该组的一部分，或者将组更改为您所属的组。 现在你可以只写入该目录，这样一个普通的旧install.packages()就可以了。

2. 使用利特勒通过sudo apt-get install littler及其方便的脚本（S） install.r和install2.r 。 我使用这些不少在命令行上，在工作和家庭多台计算机。 然后就像install.r shinydashboard一样简单（一旦你将install.r复制或链接到$PATH ）。

3. 如果你坚持，使用大锤并以root身份启动R. 由于权限升级，这通常不是一个好主意。

Answer 3

如果您使用Shiny Server，则需要使用root权限安装所有R软件包。 有关详细信息，请参阅Shiny Server管理指南的第1.3.4节 。

Answer 4

这个答案应该有效： https ： //stackoverflow.com/a/28834778/719016

我现在意识到将软件包安装为R而不是sudo R时是一个权限问题。

我通过安装$USER然后使用lib.loc指向库来暂时解决它：

library(shinydashboard, lib.loc="/home/avilella/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1")

Answer 5

在sudo中安装库。

1- su #to in mode sudoer 2- tape the password 3- R 4- install.packages（'shinydashboard'）

Answer 6

我对“d3heatmap”包有类似的问题。 它在RStudio（桌面和Web）中运行，但在Web浏览器中出错。

唯一可行的解​​决方案是在“root”帐户下从R命令行安装软件包。