问题（bug？）与MonetDB.R和dbWriteTable与csvdump = TRUE

Question

我们在一个闪亮的应用程序中使用R和MonetDB.R设法在30秒左右（在MacBook Pro上）写入1.7 M行：

dbWriteTable(conn, tableName, Dt,overwrite=TRUE, csvdump=TRUE)

据我们了解的MonetDB.R代码先保存在/tmp文件夹中的一个表csv格式，然后被装入MonetDB数据库COPY INTO

我们刚刚尝试过centos服务器和RStudio服务器，我们在/tmp的临时文件夹上遇到了访问权限错误。

我们用经典解决了这个问题

chmod -R 777 /tmp

但是，如果我们在应用程序中运行这部分内容，我们似乎必须再次这样做，因此它看起来不是一个可扩展的解决方案。

是否有可能获得更稳定和可扩展的解决方案？

（此外，这个功能在MonetDB 0.94中有记录，但它没有出现在CRAN的0.95文档中的任何地方 - 我们能否安全地假设这是一个错字并且该功能将保留？）

Answer 1

MonetDB.R使用R的tempfile()来创建临时CSV文件。 tempfile依次调用tempdir来获取临时目录。 您可以通过环境变量TMPDIR和其他来控制此目录的位置。 有关详细信息，请参阅?tempdir 。

例如

$ TMPDIR=/tmp/foo R -e "print(tempfile())"
[1] "/tmp/bar/Rtmp7UKG0k/file1173e13a4477c"

$ TMPDIR=/tmp/bar R -e "print(tempfile())"
[1] "/tmp/foo/RtmpPxx76t/file1174a409c06a2"

关于您的其他问题，csvdump功能将保留，因为MonetDB在批量CSV加载时非常快。