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与ggplot2的相关矩阵图

[英]Correlation matrix plot with ggplot2

我想创建一个相关矩阵图,即一个图,其中每个变量在散点图中绘制,而不是像pairs()splom()那样相互splom() 我想用ggplot2做这个。 请看这里的例子 该链接提到了某人在ggplot2中编写的代码,但是,它已经过时且不再有效(即使在您更换了已弃用的部分之后)。

可以通过循环中的循环然后使用multiplot()来做到这一点,但必须有更好的方法。 我尝试将数据集熔化为long,然后复制值和变量,然后使用facet。 这几乎给你一些正确的东西。

d = data.frame(x1=rnorm(100),
               x2=rnorm(100),
               x3=rnorm(100),
               x4=rnorm(100),
               x5=rnorm(100))
library(reshape2)
d = melt(d)
d$value2 = d$value
d$variable2 = d$variable

library(ggplot2)
ggplot(data=d, aes(x=value, y=value2)) +
  geom_point() +
  facet_grid(variable ~ variable2)

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这使得一般结构正确,但仅适用于绘制每个变量对自己。 是否有一些更聪明的方法来做到这一点,而不诉诸2循环?

library(GGally)

set.seed(42)
d = data.frame(x1=rnorm(100),
               x2=rnorm(100),
               x3=rnorm(100),
               x4=rnorm(100),
               x5=rnorm(100))

# estimated density in diagonal
ggpairs(d)

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# blank
ggpairs(d, diag = list("continuous"="blank")

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使用PerformanceAnalytics库:

library("PerformanceAnalytics")
chart.Correlation(df, histogram = T, pch= 19)

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暂无
暂无

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